2018年6月Nature Methods上發(fā)表了一篇關(guān)于機(jī)器學(xué)習(xí)分析特定基因集內(nèi)部關(guān)系工具的文章惕它,簡(jiǎn)單來說就是竹勉,通常我們做了差異基因分析得到一個(gè)基因集合,然后會(huì)用GO/KE...
2018年6月Nature Methods上發(fā)表了一篇關(guān)于機(jī)器學(xué)習(xí)分析特定基因集內(nèi)部關(guān)系工具的文章惕它,簡(jiǎn)單來說就是竹勉,通常我們做了差異基因分析得到一個(gè)基因集合,然后會(huì)用GO/KE...
我們提出了Augur静稻,一種在單細(xì)胞數(shù)據(jù)中對(duì)生物擾動(dòng)最敏感的細(xì)胞類型進(jìn)行優(yōu)先排序的方法。Augur采用了一個(gè)機(jī)器學(xué)習(xí)框架來量化高維空間中擾動(dòng)細(xì)胞和未擾動(dòng)細(xì)胞的可分離性。我們?cè)趩?..
說在前面 Immugent在前段時(shí)間的一篇推文中:SciBet:一個(gè)軟件解決單細(xì)胞注釋所有煩惱[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4Mj...
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的普及挎狸,為生命科學(xué)的研究提供了全新的手段《峡基于高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序锨匆,既能發(fā)現(xiàn)特定組織中可能的細(xì)胞類型,也能了解不同細(xì)胞組成上的差別冬筒,更能通過基因表達(dá)圖譜...
并不覺得ggplot2作圖多好看,尤其是箱線圖和柱狀圖需要大量的修飾舞痰,現(xiàn)在介紹ggplot2做分組箱線圖土榴,添加箱子的bar和均值的幾個(gè)函數(shù) stat_boxplot() 函數(shù)...
WGCNA原理和分析流程[http://www.reibang.com/p/9331eb5377d1] 單細(xì)胞WGCNA分析方法+隨機(jī)森林[https://www.jian...
論文 Pan-African genome demonstrates how population-specific genome graphs improve high-t...
適用背景 在單細(xì)胞分析中响牛,必要的一步是對(duì)每個(gè)細(xì)胞進(jìn)行注釋玷禽,這相當(dāng)于給每個(gè)細(xì)胞打個(gè)標(biāo)簽,或者說起個(gè)別名呀打,這些信息都存在@meta.data信息里论衍,所以不用特意去更改細(xì)胞名字,S...
常見問題: 1)Seurat CCA整合分析后什么情況下用RNAassay聚磺,什么時(shí)候用intergratedassay坯台? conserved cell type marker...