全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome-wide association study劫狠，GWAS）是應(yīng)用基因組中數(shù)以百萬級別的單核苷酸多樣性（Single Nucleotide Plo...
發(fā)簡信
IP屬地：北京
-
全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)protocol -
植物啟動子-順式作用元件-批量提取-預(yù)測-可視化分析寫在前面 以前總看到問題是莉测，基因結(jié)構(gòu)可視化的問題峦失；現(xiàn)在則變成了啟動子元件的預(yù)測或者說可視化鸵荠。這本身比較簡單，也比較玄乎，所以我一直不是太樂意與別人討論。但學(xué)院今天斷網(wǎng)，手上的...
-
TBtools | 批量計(jì)算蛋白分子量泻轰、等電點(diǎn)技肩、不穩(wěn)定系數(shù)、脂溶指數(shù)和親水指數(shù)寫在前面 最近了解了一些與蛋白質(zhì)分析相關(guān)的文稿浮声，有TBtools老鐵用戶提供了不少參考資料和分析建議虚婿。早晨，他突然提起了泳挥，一些蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析相關(guān)指標(biāo)的計(jì)算然痊，鼓搗起來還是麻...
-
TMHMM 2.0--蛋白質(zhì)的跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測如何預(yù)測一個蛋白是否具有跨膜螺旋（TMH）？ 蛋白結(jié)構(gòu)決定蛋白功能屉符，利用生物學(xué)在線軟件工具TMHMM Server,v.2.0版本是蛋白質(zhì)跨膜螺旋的在線分析工具剧浸。TMHMM是...
-
幾個預(yù)測蛋白結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)的在線工具
1.預(yù)測理化性質(zhì)：分子量(Da)矗钟、等電點(diǎn)(PI)\不穩(wěn)定系數(shù)(Instability index)唆香、親水指數(shù)(Grand average of hydropathicity-...
-
CFVisual繪制Motif+基因結(jié)構(gòu)+結(jié)構(gòu)域+進(jìn)化樹+啟動子圖的單獨(dú)或組合圖1. 軟件簡介 CFVisual_V2.1軟件是一款借助Python語言的matplotlib庫和PySide2庫進(jìn)行生物序列結(jié)構(gòu)繪圖的數(shù)據(jù)可視化軟件，主要用于生物信...
-
進(jìn)化樹構(gòu)建背景資料一吨艇、背景資料 進(jìn)化樹（evolutionary tree）又名系統(tǒng)樹（phylogenetie tree）進(jìn)化樹躬它，用來表示物種間親緣關(guān)系遠(yuǎn)近的樹狀結(jié)構(gòu)圖。在進(jìn)化樹中东涡，各個分類...
-
分子進(jìn)化樹構(gòu)建及數(shù)據(jù)分析方法介紹轉(zhuǎn)自：https://www.plob.org/article/994.html 方法的選擇 首先是方法的選擇冯吓。 基于距離的方法有UPGMA、ME（Minimum Evolu...
-
構(gòu)建發(fā)育樹 Bootstrap值
即自展值疮跑，可用來檢驗(yàn)所計(jì)算的進(jìn)化樹分支可信度组贺。Bootstrap幾乎是構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹一個必須的選項(xiàng)。一般Bootstrap的值>70%祖娘，則認(rèn)為構(gòu)建的進(jìn)化樹較為可靠锣披。如果Boo...
