森言森語 眼看著十一月又到中旬钢猛，時(shí)間是過得真快岂丘。一個(gè)多月沒怎么寫東西了郑趁，實(shí)際上是有些懶。 這不馬上就要開題論證了冈止，聽說定量是最受學(xué)生喜愛的實(shí)驗(yàn)了酌媒。 于是我也準(zhǔn)備趕在開題之前在...
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批量設(shè)計(jì)qPCR引物贡羔，可最大限度滿足qPCR引物設(shè)計(jì)的黃金法則 -
qPCR引物設(shè)計(jì)與驗(yàn)證引物設(shè)計(jì)是 qPCR[https://www.biomart.cn/supply/10010115.htm] 非常重要的環(huán)節(jié)。今天小編給大家推薦 2 款簡單實(shí)用的在線 qPC...
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使用TBtools提取基因組CDS并轉(zhuǎn)換成蛋白文件基因功能注釋需要蛋白文件耸弄，有時(shí)候注釋或下載的基因組沒有蛋白文件咧虎，需提取并轉(zhuǎn)換，據(jù)師兄師弟說gffread提取結(jié)果有問題计呈，可能造成移碼等砰诵，因此使用TBtools進(jìn)行提取并轉(zhuǎn)...
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Window下如何下載SRA數(shù)據(jù)跑DADA2流程由于沒有服務(wù)器，只能自己搗鼓著用windows的cmd命令行來批量下載一些數(shù)據(jù)捌显，但是windows下高通量測(cè)序數(shù)據(jù)（如sra）下載體驗(yàn)真的很差茁彭，沒辦法，只能硬著頭皮去搞 一扶歪、...
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如何下載sra數(shù)據(jù)理肺，轉(zhuǎn)化fastq進(jìn)行分析
前言 本文分享如何從NCBI數(shù)據(jù)庫下載我們需要的數(shù)據(jù)，進(jìn)行我們自己的數(shù)據(jù)分析。該過程的思路相對(duì)清晰妹萨，主要需要完成以下三個(gè)步驟年枕。 1. SRA ID 號(hào)查詢 1.1. 我們需要...
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RPKM、FPKM乎完、TPM詳解
簡寫 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千個(gè)堿基的轉(zhuǎn)錄每百萬映射讀取的rea...
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[實(shí)戰(zhàn)1] Polycomb associates genome-wide with a specific RNA polymerase II variant, and regulates me...寫在前面：參考-# 給學(xué)徒ChIP-seq數(shù)據(jù)處理流程[http://www.reibang.com/p/1384173c353b] 目錄軟件安裝[https://www....
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實(shí)用熏兄！便攜且高效 去除 基因組序列和注釋 碎片寫在前面 目前，有大量物種的基因組序列和注釋信息公布树姨。幾乎所有科研人員都可以下載并使用這些數(shù)據(jù)摩桶，分析和驗(yàn)證自己的科研假設(shè)。常常帽揪，我們會(huì)遇到一些小問題典格，比如基因組序列文件中包含...
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物種間共線性circos——作圖步驟早先寫過，但是有不少朋友還是在后臺(tái)留言台丛，無法完全重復(fù)耍缴。我仔細(xì)看了之后發(fā)現(xiàn)，的確是我在有些細(xì)節(jié)上寫的不夠詳細(xì)挽霉。但是不想去完善了防嗡。畢竟tbtools的實(shí)現(xiàn)邏輯已經(jīng)很簡單了。 那就...
