去重 按symbol列去重，常見標(biāo)準(zhǔn)有3個(gè)：最大值/平均值/隨機(jī)去重 方法1.隨機(jī)去重 方法2.求平均值
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GEO數(shù)據(jù)挖掘--去掉重復(fù)基因
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01LaTeX學(xué)習(xí)系列之---TeX的介紹與認(rèn)識(shí)
01TeX的介紹與認(rèn)識(shí) 目錄 本系列是有關(guān)LaTeX的學(xué)習(xí)系列佑吝，共計(jì)19篇熙宇，本章節(jié)是第1篇鳖擒。前一篇：無后一篇：02LaTeX學(xué)習(xí)系列之---TeX環(huán)境的搭建總目錄：19LaT...
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測(cè)序原理：一代二代三代測(cè)序原理詳解1. 一代測(cè)序(Sanger sequencing) 雙脫氧鏈終止法采用DNA復(fù)制原理。 Sanger測(cè)序反應(yīng)體系中包括目標(biāo)DNA片段烫止、脫氧三磷酸核苷酸（dNTP）蒋荚、雙脫氧三...
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火起來的“相分離”是什么？相分離或者說相變（Phase separation烈拒，Phase Transition）是目前比較火的一個(gè)研究領(lǐng)域圆裕，已有的研究表明相分離在細(xì)胞中普遍存在，與基因組的組裝荆几、轉(zhuǎn)錄調(diào)...
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【三代】淺談三代測(cè)序平臺(tái)2011年吓妆，美國(guó)Pacific Biosciences 公司正式發(fā)售第三代測(cè)序系統(tǒng)—PacBio RS。這是一臺(tái)革命性的DNA測(cè)序系統(tǒng)吨铸，它融合了新穎的單分子測(cè)序技術(shù)和高級(jí)的分...
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TCGA FPKM 轉(zhuǎn)化為 TPM
FPKM 一般來說不太好用行拢，轉(zhuǎn)為TPM進(jìn)行后續(xù)的分析比較合適。下面是FPKM轉(zhuǎn)化為TPM的R實(shí)現(xiàn)： 參考： RNA-Seq的Counts和FPKM數(shù)據(jù)如何轉(zhuǎn)換成TPM诞吱？[ht...
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RNA-Seq分析|RPKM, FPKM, TPM, 計(jì)算對(duì)比在高通量測(cè)序當(dāng)中舟奠，很重要的一塊就是檢測(cè)基因的表達(dá)量，它是差異分析和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的基礎(chǔ)房维。與q-PCR相似沼瘫，基因表達(dá)量的衡量也是采取相對(duì)定量的方法。落在一個(gè)基因區(qū)域內(nèi)的read...
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RPKM, FPKM, TPM
什么是測(cè)序深度和測(cè)序覆蓋度 測(cè)序深度（depth）是指測(cè)序得到的總堿基數(shù)與待測(cè)基因組大小的比值咙俩，可以理解為基因組中每個(gè)堿基被測(cè)序到的平均次數(shù)耿戚。測(cè)序深度 = reads長(zhǎng)度 ×...
