當我們畫熱圖(heatmap)的時候,如果基因的名字比較多的時候,在熱圖中展示的話代箭,就會出現(xiàn)名字重疊的情況墩划,針對這個情況,我們有兩種比較好的解決辦法嗡综,第一是在熱圖中僅顯示關注...
這篇一部分復現(xiàn)的文章是Comprehensive Analysis of the Expression and Prognosis for E2Fs in Human Bre...
DAVID富集分析 DAVID富集支持多種基因名類型乙帮,本次以genesymbol為例 DAVID:https://david.ncifcrf.gov/ 進入之后跟著以下步驟操...
在基因芯片數(shù)據(jù)或其他類型數(shù)據(jù)中,采用計算所有樣本的平均值從而進行填充极景,如果需要用中位數(shù)或其他統(tǒng)計量填充時只需修改相應的方法即可 #1. 檢查是否有缺失值 which(is.n...
GSEA的分析匯總 學習GSEA 生信技能樹 GSEA的統(tǒng)計學原理試講 GSEA GSEA這個java軟件使用非常方便察净,只需要根據(jù)要求做好GCT/CLS格式的input文件就...
R語言繪圖包系列: R語言繪圖包01--優(yōu)秀的拼圖包patchwork[http://www.reibang.com/p/e57555d48c91] R語言繪圖包02--熱...
#mRNA表達矩陣與GROUP文件樣式氢卡,heatmap樣式見文章最后 library(limma) mRNA <- read.table("表達矩陣.txt",sep = "...
數(shù)據(jù)框:mRNA; 基因名列:Symbol(在該數(shù)據(jù)框最后一列)晨缴; results = t(sapply(split(mRNA,mRNA$Symbol),function(x...
單細胞繪圖系列: Seurat繪圖函數(shù)總結[http://www.reibang.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
簡介 這本書是一位韓國的數(shù)據(jù)科學家寫的書译秦,書并不新,幾年前的击碗,虛擬機都已經(jīng)過時筑悴,但全書讀下來最大的感受是內(nèi)容寫的很詳細,可以照著步驟實踐稍途,加深了對機器學習的理解阁吝,或者說是一本...