重建系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系=分子數(shù)據(jù)建樹？ 一提到phylogeny，我們的第一反應(yīng)就是分子數(shù)據(jù)建樹。這種理解是片面的，但也反映了一些它的分類學(xué)的區(qū)別： 首先，分類學(xué)在根據(jù)charac...
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系統(tǒng)發(fā)育（Phylogeny）簡介 -
群體結(jié)構(gòu)——系統(tǒng)發(fā)育樹的基本概念本文具體介紹生物信息學(xué)分析中最常用的群體結(jié)構(gòu)展示圖形——系統(tǒng)發(fā)育樹，分為兩部分進(jìn)行說明：系統(tǒng)發(fā)育樹的基本概念和系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建贬堵。 全文重點(diǎn): 第一部分 系統(tǒng)發(fā)育樹是描述物種間...
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聊聊“基因組共線性”最近看了幾篇關(guān)于共線性分析的微信/簡書推送，發(fā)現(xiàn)不少研究人員把“編碼基因共線性”錯(cuò)誤地描述為“全基因組共線性”结洼。這是兩個(gè)完全不同的概念黎做，前者主要是基于蛋白水平，蛋白的保守性很...
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DNA測序原理：illumina和Pacbio今天分享DNA測序技術(shù)和原理松忍，包括illumina和pacbio測序原理引几、基本介紹和優(yōu)缺點(diǎn)對(duì)比。 Illumina測序技術(shù) 原理：邊合成邊測序 測序長度：150bp 通量：6...
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使用wgd進(jìn)行全基因組復(fù)制分析這篇教程是我在2019年9月左右分析WGD時(shí)的筆記挽铁。目前來看伟桅，背景介紹和軟件使用說明都基本沒啥問題。但是現(xiàn)在更建議大家使用wgdi進(jìn)行比較基因組學(xué)中相關(guān)分析叽掘，教程見如何用WG...
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擬南芥雌蕊端自交不親和顯性抑制因子的平行進(jìn)化今天分享一篇來自nature communications三月份的文章：Parallel evolution of dominant pistil-side self-inc...
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睡蓮基因組與開花植物的早期進(jìn)化今天分享一篇文獻(xiàn)楣铁，來自去年12月張亮生團(tuán)隊(duì)發(fā)表在nature上的一篇文章：The water lily genome and the early evolution of f...
