作者，Evil Genius 本來(lái)兒童節(jié)的推文不打算寫了，但是有粉絲問(wèn)了個(gè)問(wèn)題，我也發(fā)現(xiàn)了一個(gè)很有意思的分析，所以寫出來(lái)和大家交流一下吧。 有粉絲問(wèn)，像生信培訓(xùn)班有必要花幾千...
IP屬地：上海
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高精度空間轉(zhuǎn)錄組分析之squidpy和空間網(wǎng)絡(luò)圖 -
空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)分析細(xì)胞鄰域依賴的基因表達(dá)(分子鄰域)作者视事，Evil Genius 今天我們來(lái)繼續(xù)分享關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組的內(nèi)容，回到之前的一個(gè)分析庆揩，空間轉(zhuǎn)錄組有四大矩陣 1俐东、分子矩陣，gene X barcode订晌，這是最開(kāi)始大家拿到...
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高斯－馬爾可夫定理 以及為什么最小二乘法是最佳線性無(wú)偏估計(jì)1虏辫、背景 在做機(jī)器學(xué)習(xí)和線性回歸的時(shí)候，經(jīng)常會(huì)遇到不講道理的最小二乘法锈拨，優(yōu)化的目標(biāo)是(yi-y)^2最小砌庄，這個(gè)結(jié)論非常暴力，為啥不是三次方推励，四次方鹤耍，他的來(lái)源是什么呢？本文參考...
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10X空間轉(zhuǎn)錄組空間依賴性基因共表達(dá)表征分析之SpaceXhello验辞，大家好，其實(shí)之前已經(jīng)給大家已經(jīng)分享過(guò)很多空間基因共表達(dá)模式的文章喊衫，今天給大家介紹一個(gè)新的方法跌造，用于評(píng)斷在組織中不同空間位置或細(xì)胞類型的基因-基因共表達(dá)的表征能夠描...
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【r<-ggplot2】修改x和y軸刻度這個(gè)R tutorial描述如何使用ggplot2包修改x和y軸刻度。同樣族购，該文包含如何執(zhí)行軸轉(zhuǎn)換（對(duì)數(shù)化壳贪，開(kāi)方等）和日期轉(zhuǎn)換。 準(zhǔn)備數(shù)據(jù) 使用ToothGrowth： 請(qǐng)確...
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R語(yǔ)言ggboxplot-一文掌握箱線圖繪制所有細(xì)節(jié)作者：白介素2相關(guān)閱讀：R語(yǔ)言ggplot2繪制箱線圖R語(yǔ)言生存分析04-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型診斷R語(yǔ)言生存分析03-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型R語(yǔ)言生存分析-02-ggforestR...
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sctransform通過(guò)仿射變化對(duì)單細(xì)胞數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化參考文獻(xiàn)鏈接：《Normalization and variance stabilization of single-cell RNA-seq data using regu...
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空間轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用領(lǐng)域與研究思路
作者：路子審稿：童蒙編輯：angelica 細(xì)胞位置信息對(duì)于干細(xì)胞分化寝杖，組織發(fā)育以及腫瘤組織微環(huán)境起著重大的作用违施，那么空間轉(zhuǎn)錄組在這些研究領(lǐng)域中是如何設(shè)計(jì)如何解決科學(xué)問(wèn)題的呢...
