1.計(jì)算親緣關(guān)系矩陣 2.單性狀LMM GWAS分析 3.多性狀LMM GWAS分析 4.先填充缺失表型骡湖，再做LMM GWAS分析 5.貝葉斯稀疏線性混合模型
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3.2 GWAS：最佳線性無偏估計(jì)量——BLUE值計(jì)算（多年單點(diǎn)有重復(fù)）
GWAS中使用均值挥吵、BLUP值還是BLUE值赋咽，鄧飛老師有兩篇帖子進(jìn)行了介紹剃幌，鏈接如下关带，根據(jù)我的數(shù)據(jù)葵硕，我選擇了BLUE值竞穷。在這里提醒大家梳庆，不要一上來就忽略所有warning暖途，很...
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基因挖掘之BSA (Bulk segregation analysis)BSA作為基因組學(xué)中基因挖掘的三板斧之一卑惜，最大優(yōu)點(diǎn)是高效、經(jīng)濟(jì)驻售、簡便露久。通過選擇雙親群體分離后代中具有極端表型的個體進(jìn)行混樣，然后比較不同極端混樣池之間的多態(tài)性并結(jié)合表型進(jìn)行目...
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真核生物的轉(zhuǎn)錄起始（2）課件來源：7.3.2 真核生物的轉(zhuǎn)錄過程（2）_嗶哩嗶哩_bilibili[https://www.bilibili.com/video/BV1h741157zC?p=84]...
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站內(nèi)欺栗、外較好的GWAS教程整理
開門見山：GWAS 總體流程理解版 - 簡書[http://www.reibang.com/p/c0a032a8e7d5]全基因組重測序基礎(chǔ)及高級分析知識匯總 - 知乎[h...
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1.GWAS：原理與目的全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome-Wide Association Study毫痕， GWAS）是以連鎖不平衡（LD）為基礎(chǔ)，利用全基因組范圍內(nèi)群體中高密度的分子標(biāo)記迟几，鑒定與復(fù)雜性...
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ggplot2中facet_wrap( )的高階用法介紹ggplot2中facet_wrap( )函數(shù)中l(wèi)abeller 參數(shù)的用法 labeller參數(shù)消请，可以使用它來處理太長的facet標(biāo)簽 同時(shí)顯示變量名稱與因子值 顯示因...
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一文讀懂比較基因組學(xué)
隨著基因組測序爆炸性增長，比較基因組學(xué)已逐漸成為每個物種尤其是首次被破譯基因組的物種的必備研究內(nèi)容之一类腮。那么什么是比較基因組學(xué)呢臊泰？比較基因組學(xué)是通過對系統(tǒng)發(fā)育中的代表性物種之...
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GATK4流程學(xué)習(xí)之RNA-Seq variant calling(SNP+INDEL)GATK4流程學(xué)習(xí)之背景知識與前期準(zhǔn)備 - 簡書[http://www.reibang.com/p/97e803755fa6]GATK4流程學(xué)習(xí)之DNA-Seq varia...
