f734b9ec3c21

本次配置的環(huán)境是Linux版本的R studio server明也。直接install_github("jmzeng1314/AnnoProbe")安裝出現(xiàn)installatio...

f734b9ec3c21

@ACh_20d2 根據(jù)提供的教程，應(yīng)該是cor_dist
#' Generates a distance matrix using the square root of (1 - spearman).
#'
#' @param dat.mat Matrix of data (features X samples).
#' @return Distance structure.
#' @export
cor_dist <- function(dat.mat) {
dist.mat <- as.dist(sqrt(1 - cor(dat.mat, method = 'spearman')))
return(dist.mat)
}

基于單細(xì)胞測(cè)序的蛋白活性推斷（PISCES）分析流程筆記，凎蟀淮！

寫(xiě)在前面 感謝califano-lab[https://github.com/califano-lab]團(tuán)隊(duì)將代碼無(wú)私的分享出來(lái)=最住。=！ 本流程需要一點(diǎn)點(diǎn)R語(yǔ)言與linux基...

喂雞組的阿翔

7464 14 20

f734b9ec3c21

請(qǐng)問(wèn)各位大佬怠惶，“RegProcess('pisces-1-net-final.tsv', mat1, out.dir = 'tutorial/', out.name = 'pisces-1-net-')” 這里的mat1是不是 pisces1 <- readRDS('pisces-clust_aracne-mats/pisces-1-arac.rds')涨缚？。如果是策治，在運(yùn)行過(guò)程中連續(xù)出現(xiàn)WARNING! NOT CONVERGENT! number of iterations= 1000 是哪里出了問(wèn)題脓魏？

基于單細(xì)胞測(cè)序的蛋白活性推斷（PISCES）分析流程筆記，凎通惫！

寫(xiě)在前面 感謝califano-lab[https://github.com/califano-lab]團(tuán)隊(duì)將代碼無(wú)私的分享出來(lái)=轧拄。=！ 本流程需要一點(diǎn)點(diǎn)R語(yǔ)言與linux基...

喂雞組的阿翔

7464 14 20