Tips: 最近看單細胞ChIP-seq 文章一個圖揍庄，本來作者用base plot 畫的，因此嘗試用ggplot2 畫出base plot 風格堪遂。 圖表達意思：在小鼠胚胎發(fā)育...
IP屬地：湖北
-
重復單細胞it-ChIP文章小圖 -
使用deeptools將bam文件轉換為bw文件整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析時用到的工具。本文只對使用的工具用法進行簡單介紹萌庆。 deeptools 提供兩個bam轉換為bw的命令溶褪，分別是bamCove...
-
GSA、GSEA践险、ssGSEA猿妈、GSVA的算法原理及它們的聯(lián)系與區(qū)別一、 簡述 ? ? 為了從基因的表達水平中得到更加具體直觀的生物學功能變化的信息巍虫，多種基于已知的基因集的分析方法應運而生彭则。其中，基因集分析（Gene Set Analysis...
-
WGCNA（7）：重新繪制GS—MM散點圖GS-MM散點圖用于篩選hub gene占遥，但是之前的圖實在是有點丑俯抖，放在文章里好像有點拉胯，所以準備重新繪制筷频。前期過程在專題（3）中已經介紹過了蚌成，這里只有后期優(yōu)化。WGCNA...
-
用ggplot2做富集分析氣泡圖數據準備 富集分析軟件由于做的材料不是模式植物凛捏，用clusterProfiler上面配置起來有點困難担忧，最要命的是基因組數據庫并沒有上傳NCBI，無法用OrgDb坯癣，當然也可以自...
