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蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)的缺失值填充
缺失值填充在數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域的預(yù)處理過(guò)程繞不過(guò)去的一個(gè)坎黄娘，蛋白質(zhì)組學(xué)也不例外，簡(jiǎn)單記錄下天通，可能有些地方有其特殊之處泊窘。 分析缺失值來(lái)源：完全隨機(jī)缺失（MCAR，如質(zhì)譜儀抖動(dòng)像寒，對(duì)數(shù)據(jù)...
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DIA技術(shù)及其軟件工具介紹前言 關(guān)于蛋白質(zhì)組學(xué)烘豹，你是不是已經(jīng)聽(tīng)了太多公司的宣講，介紹了一大堆的技術(shù)名詞诺祸，反而越聽(tīng)越懵懂携悯，腦袋一團(tuán)亂麻？就和傳話游戲一樣序臂，當(dāng)我們接收了多手信息以后蚌卤，得到的信息就越不準(zhǔn)確。...
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【1】蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定軟件之X!Tandem1. 簡(jiǎn)介 X!Tandem是GPM：The Global Proteome Machine（主要基于Web的開(kāi)源用戶界面奥秆，用于分析和顯示蛋白質(zhì)鑒定數(shù)據(jù)逊彭。關(guān)于GPM的更多內(nèi)容...
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蛋白質(zhì)組學(xué)資料
簡(jiǎn)單收集一下全網(wǎng)的蛋白組學(xué)的分析 生信技能樹 1. 蛋白質(zhì)組學(xué)第1期-認(rèn)識(shí)基礎(chǔ)概念[https://mp.weixin.qq.com/s/PBPqiX1Ks5EiS2HBG5...
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顏值夠格的風(fēng)險(xiǎn)森林圖0.輸入數(shù)據(jù)和R包 在生信星球公眾號(hào)聊天框回復(fù)“forest779”即可獲得輸入數(shù)據(jù)。也可以自己根據(jù)表達(dá)矩陣與臨床信息生成构订，如下： 1.多因素cox回歸 建模就一句代碼侮叮，出森...
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cox的predict結(jié)果與加權(quán)乘積居然不一樣1.問(wèn)題起源 predict的參數(shù)type默認(rèn)值就是“l(fā)p”，代表線性模型悼瘾，理論上和大量文章里描述的公式應(yīng)該是結(jié)果相同的囊榜。比如這個(gè)： https://www.ncbi.nlm...
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基因長(zhǎng)度并不是end-start需求 tpm、fpkm這樣的數(shù)據(jù)亥宿，計(jì)算公式里都有“基因有效長(zhǎng)度”卸勺，有些地方直接叫基因長(zhǎng)度。之前計(jì)算這些烫扼，都是采用最快的方式—找豆豆曙求。今天想要把這部分逐漸加到課程里，我就必須要...
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生信技能樹蛋白組文章匯總
1. 蛋白質(zhì)組學(xué)第1期-認(rèn)識(shí)基礎(chǔ)概念 2. 蛋白質(zhì)組學(xué)第2期-認(rèn)識(shí)蛋白質(zhì)組學(xué)原始數(shù)據(jù) 3. 蛋白質(zhì)組學(xué)第3期-蛋白質(zhì)組學(xué)的三大元素 4. 蛋白質(zhì)組學(xué)第4期-文章搜庫(kù)過(guò)程復(fù)現(xiàn) ...
