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缺失值填充在數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域的預處理過程繞不過去的一個坎椅棺,蛋白質(zhì)組學也不例外,簡單記錄下齐蔽,可能有些地方有其特殊之處两疚。 分析缺失值來源:完全隨機缺失(MCAR,如質(zhì)譜儀抖動含滴,對數(shù)據(jù)...
前言 關(guān)于蛋白質(zhì)組學诱渤,你是不是已經(jīng)聽了太多公司的宣講,介紹了一大堆的技術(shù)名詞谈况,反而越聽越懵懂勺美,腦袋一團亂麻?就和傳話游戲一樣碑韵,當我們接收了多手信息以后赡茸,得到的信息就越不準確。...
1. 簡介 X!Tandem是GPM:The Global Proteome Machine(主要基于Web的開源用戶界面泼诱,用于分析和顯示蛋白質(zhì)鑒定數(shù)據(jù)坛掠。關(guān)于GPM的更多內(nèi)容...
簡單收集一下全網(wǎng)的蛋白組學的分析 生信技能樹 1. 蛋白質(zhì)組學第1期-認識基礎(chǔ)概念[https://mp.weixin.qq.com/s/PBPqiX1Ks5EiS2HBG5...
0.輸入數(shù)據(jù)和R包 在生信星球公眾號聊天框回復“forest779”即可獲得輸入數(shù)據(jù)启绰。也可以自己根據(jù)表達矩陣與臨床信息生成昂儒,如下: 1.多因素cox回歸 建模就一句代碼,出森...
1.問題起源 predict的參數(shù)type默認值就是“l(fā)p”委可,代表線性模型渊跋,理論上和大量文章里描述的公式應該是結(jié)果相同的。比如這個: https://www.ncbi.nlm...
需求 tpm着倾、fpkm這樣的數(shù)據(jù)拾酝,計算公式里都有“基因有效長度”,有些地方直接叫基因長度卡者。之前計算這些蒿囤,都是采用最快的方式—找豆豆。今天想要把這部分逐漸加到課程里崇决,我就必須要...
1. 蛋白質(zhì)組學第1期-認識基礎(chǔ)概念 2. 蛋白質(zhì)組學第2期-認識蛋白質(zhì)組學原始數(shù)據(jù) 3. 蛋白質(zhì)組學第3期-蛋白質(zhì)組學的三大元素 4. 蛋白質(zhì)組學第4期-文章搜庫過程復現(xiàn) ...
作業(yè)中參考了:http://www.reibang.com/p/bc1fe435879c http://www.reibang.com/p/d10a85f21889 ht...
大家好,今天和大家分享的是19年1月份在J. Cell. Physiol(IF:4.522) 上的一篇文章扑庞,"Identification of the molecular ...
影響因子:6.2 從投稿到接收不到2個月 關(guān)于非腫瘤生信栅隐,我們也解讀過很多塔嬉,主要有以下類型 1 單個疾病分析 2 單個疾病結(jié)合免疫浸潤玩徊,鐵死亡,自噬等相關(guān)分析 3 兩種相關(guān)疾...