Introduction ANI 是指平均核苷酸一致性（Average Nucleotide Identity），它是一種用來(lái)比較兩種基因組之間相似度的方法蒸甜。ANI 主要用于...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
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使用FastANI與Skani計(jì)算平均核苷酸一致性(ANI) -
生信小白如何繪制蛋白序列的二級(jí)結(jié)構(gòu)可視化圖大家經(jīng)常在文獻(xiàn)中看到非常漂亮的多序列比對(duì)圖棠耕，上面標(biāo)注了各種蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)的信息，現(xiàn)在小白將目前見過(guò)的最好看的序列比對(duì)圖和蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)的組合圖的作圖方法作分享柠新，希望對(duì)大家的科研工...
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kraken2 微生物物種分類kraken 是微生物組分析進(jìn)行物種分類的工具窍荧，目前已經(jīng)是第二代 kraken2 了。kraken2 對(duì)比 kraken 重點(diǎn)優(yōu)化了數(shù)據(jù)庫(kù)創(chuàng)建速度和數(shù)據(jù)庫(kù)大小恨憎，以及分類速度蕊退。...
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超算平臺(tái) | blastp比對(duì)和提取蛋白序列
以下為Ginkgo_biloba.sh 的內(nèi)容，用擬南芥蛋白序列blast銀杏。 以下為Picea_abies.sh 的內(nèi)容瓤荔，用擬南芥蛋白序列blast挪威云杉净蚤。
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宏基因組標(biāo)準(zhǔn)流程--metaWRAP1. metaWRAP簡(jiǎn)介 [MetaWRAP](https://github.com/bxlab/metaWRAP "MetaWRAP")旨在成為一個(gè)易于使用的宏基因組數(shù)據(jù)...
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將序列比對(duì)的結(jié)果保存為漂亮的圖片將序列比對(duì)的結(jié)果保存為漂亮的圖片 多序列比對(duì)在分子生物學(xué)中是一個(gè)基本方法，用來(lái)發(fā)現(xiàn)特征序列输硝，進(jìn)行蛋白分類今瀑，證明序列間的同源性，幫助預(yù)測(cè)新序列二級(jí)結(jié)構(gòu)與三級(jí)結(jié)構(gòu)腔丧，確定PCR引物...
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做出漂亮的序列比對(duì)alignment圖——ENDscript/ESPript大家經(jīng)常在文獻(xiàn)中看到非常好看的序列比對(duì)圖放椰，現(xiàn)在筆者將目前見過(guò)的最好看的序列比對(duì)圖的作圖方法作分享，希望對(duì)大家的科研工作有所幫助愉粤，效果圖如下： 1.在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)砾医、Genbank...
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四種獲取fasta序列長(zhǎng)度的方法在處理fasta序列的時(shí)候，我們經(jīng)常需要獲取每一條fasta序列的長(zhǎng)度衣厘。今天小編就跟大家來(lái)分享四種獲取fasta序列長(zhǎng)度的方法如蚜。 一、awk 輸出為 二影暴、bioawk 得到的...
