title: muma-代謝組學(xué)單變量和多變量統(tǒng)計分析R包date: 2019-02-23 21:38:55tags: [單變量, 多元統(tǒng)計, ...
投稿
收錄了24篇文章 · 109人關(guān)注
-
muma-代謝組學(xué)單變量和多變量統(tǒng)計分析R包 -
MetaboAnalystR包靈活涮阔、可重復(fù)的分析代謝組數(shù)據(jù)R包文檔參考：https://www.metaboanalyst.ca/docs/RTutorial.xhtml#Workflow:%20Cas...
-
潛在因素混合模型：LFMM—— R包lfmm在自然群體（區(qū)別于強人工選擇）中，如果我們感興趣的數(shù)量性狀表現(xiàn)出與特定的地理環(huán)境變量有高度的關(guān)聯(lián)性，隨著環(huán)境變量的改變而變化，則這些環(huán)境變量往往...
-
用ropls進行代謝組PCA, PLS, PLS-DA, OPLS, or OPLS-DA分析簡介 主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是對變量數(shù)超過樣本數(shù)量或變量之間存在多重共線性的組學(xué)數(shù)據(jù)進行可視化末盔、回歸、分類和特征選擇的常用...
-
如何在CNGBdb存儲代謝組數(shù)據(jù)？
你的組學(xué)數(shù)據(jù)都存在哪里痕慢？NCBI，EBI....除了這些你還可以選擇國家基因庫生命大數(shù)據(jù)平臺（CNGBdb）涌矢。 2020年7月31日掖举，國家基因庫...
-
代謝組研究必備數(shù)據(jù)庫【HMDB】 | 數(shù)據(jù)庫推薦
做代謝組研究，你一定會用到它——HMDB 人類代謝組數(shù)據(jù)庫(HMDB)于2007年首次發(fā)布娜庇，被認為是人類代謝研究的標準代謝組學(xué)資源拇泛，包含有關(guān)人類...
-
R package：MAIT峰注釋
snThres表示的是信噪比參數(shù)的設(shè)置，rtStep生成峰文件的步長由于這里用的是示例數(shù)據(jù)思灌，如果是自己的數(shù)據(jù)那么dataDir后接的就是自己設(shè)置...
-
R package：MALDIquant質(zhì)譜峰的可視化安裝 查看MALDIquant包帶的數(shù)據(jù) 共有16個樣本 標準化 減少峰的波動俺叭，克服方差均值的相互影響
-
R package（一）：xcms代謝組學(xué)初探xcms用于LC-MS和GC-MS數(shù)據(jù)分析，用于色譜分離和單光譜質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理和可視化的框架泰偿。導(dǎo)入AIA / ANDI NetCDF熄守，mzXML，...
-
KEGG數(shù)據(jù)庫：查找某個通路上的所有基因
1.kegg數(shù)據(jù)庫下載 通常我們?nèi)绻阎硞€基因，想對這個基因做通路很簡單裕照，直接用kegg的網(wǎng)頁注釋就可以攒发；如果想知道某個通路里相關(guān)的所有基因列...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1796179/1562410489.jpg', '推薦專題《代謝組學(xué)》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.reibang.com/c/1f2ecee3b88e?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認gb2312'));){kind=link}