嗨嗨，好久不見(jiàn)睛低，太久沒(méi)有更新啦谎痢。前幾天和老師討論實(shí)驗(yàn)的時(shí)候磕昼，他提到了這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)挺方便，之前只是聽(tīng)說(shuō)過(guò)节猿，沒(méi)有研究過(guò)怎么用掰烟，回來(lái)之后我就仔細(xì)看了下，...

1沐批、鏈特異性測(cè)序的目的現(xiàn)在二代測(cè)序主要有PE和SE兩種策略，PE主要用于RNA-seq蝎亚，SE主要用于小RNA測(cè)序（短片段文庫(kù)測(cè)序）九孩。PE測(cè)序，我...

1. 什么是位點(diǎn)頻譜(site frequency spectrum)? 位點(diǎn)頻譜也叫等位基因頻譜(allele frequency spect...

[連鎖不平衡粗俗的說(shuō)就是：這幾個(gè)基因耍流氓发框，喜歡抱團(tuán)遺傳躺彬，不再隨機(jī)。而連鎖不平衡衰減是指在基因組上，隨著物理距離的增大宪拥，兩個(gè)連鎖的的等位基因的連...

一仿野、技術(shù)原理 基因組研究的維度可以分為很多種，例如下圖所示 其中Hi-C是研究三維結(jié)構(gòu)的一種方法她君。Hi-C技術(shù)源于染色體構(gòu)象捕獲（Chromos...

關(guān)于為何要進(jìn)行SNP的過(guò)濾： 第一，低質(zhì)量和無(wú)信息的SNP會(huì)影響后續(xù)群體結(jié)構(gòu)或GWAS的分析結(jié)果校镐，甚至影響后續(xù)對(duì)生物學(xué)問(wèn)題的解釋?zhuān)坏诙诒猓后w研究...

基因組中重復(fù)序列大體分為兩類(lèi)：串聯(lián)重復(fù)（Tandem repeats，Tandem Duplication） （TRF可預(yù)測(cè)）散在重復(fù)（Disp...

1.stack尋找位點(diǎn)1)數(shù)據(jù)預(yù)處理數(shù)據(jù)下機(jī)經(jīng)過(guò)拆分去接頭獲得原始數(shù)據(jù) 由于拆分?jǐn)?shù)據(jù)用的引物街頭長(zhǎng)度不一鸟廓，獲得的原始數(shù)據(jù)的長(zhǎng)度也有差異从祝，這對(duì)后續(xù)...

RAD-Seq(restriction site-associated DNA sequencing)最開(kāi)始指的是2008年發(fā)表在PLOS ON...