不知為何官網(wǎng)對(duì)于軟件結(jié)果的說(shuō)明文件被刪除掉了黔帕，還好有其他有心人保存了下來(lái) 原文在這：http://www.reibang.com/p/341f...
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空間轉(zhuǎn)錄組-百創(chuàng)S1000下機(jī)數(shù)據(jù)分析軟件BSTMatrix
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如何給Seurat對(duì)象的基因重命名鳞青？【基因名轉(zhuǎn)換】2022-07-27
適用背景 在單細(xì)胞分析中，必要的一步是對(duì)每個(gè)細(xì)胞進(jìn)行注釋算芯，這相當(dāng)于給每個(gè)細(xì)胞打個(gè)標(biāo)簽，或者說(shuō)起個(gè)別名存璃，這些信息都存在@meta.data信息里叉存，...
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最近7.7分SCI咐刨，單細(xì)胞分析+WGCNA+實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，有實(shí)驗(yàn)條件者可輕易模仿扬霜，腫瘤非腫瘤均適合定鸟！發(fā)表雜志：Biological Procedures Online 影響因子：7.71 生信分析咨詢 請(qǐng)關(guān)注“生信小課堂”全網(wǎng)同名 研究背景： ...
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基因克隆基因克隆（gene cloning）或分子克隆,又稱為重組DNA技術(shù)著瓶，是應(yīng)用酶學(xué)方法联予，在體外將不同來(lái)源的DNA分子通過(guò)酶切、連接等操作重...
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單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實(shí)操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] ...
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單細(xì)胞測(cè)序文章圖表復(fù)現(xiàn)04—聚類分群的resolution參數(shù)問(wèn)題
本文是參考學(xué)習(xí)CNS圖表復(fù)現(xiàn)04—單細(xì)胞聚類分群的resolution參數(shù)問(wèn)題[https://mp.weixin.qq.com/s?src=1...
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轉(zhuǎn)錄組分析——利用GEO數(shù)據(jù)挖掘構(gòu)建基因表達(dá)圖譜一材原、前言 前段時(shí)間主管讓我在GEO數(shù)據(jù)庫(kù)弄個(gè)表達(dá)圖譜沸久，準(zhǔn)備接下來(lái)做各種轉(zhuǎn)錄組分析，現(xiàn)在回過(guò)頭來(lái)余蟹，覺(jué)得這個(gè)東西比較簡(jiǎn)單卷胯，十分適合上手練習(xí)。思考了一...
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scRNAseq雙細(xì)胞去除-1: DoubletFinder10x平臺(tái)的雙細(xì)胞率（符合泊松分布1）： 根據(jù)Poisson分布客叉，單個(gè)液滴包含超過(guò)一個(gè)細(xì)胞（doublets或multiplets）的頻率隨著上...
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對(duì)于單個(gè)單細(xì)胞樣本诵竭，多少的測(cè)序數(shù)據(jù)量才合適前言，今天剛好在群里看到有人問(wèn)“請(qǐng)問(wèn)10X一個(gè)樣本測(cè)多少個(gè)G比較好”兼搏，群主給出了答復(fù)卵慰，但是我對(duì)300這個(gè)數(shù)怎么來(lái)的還是不理解，出于好奇心佛呻，于是去...
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R包VennDiagram的韋恩圖繪制及交集元素的提取韋恩（Venn）圖是常見(jiàn)統(tǒng)計(jì)圖之一裳朋，用于展示各樣本（或分組）之間共有（或特有）元素的數(shù)量（或比例）。 例如做RNA-seq的最直接目的吓著，大多是鑒...
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