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    一行命令完成RNAseq差異分析+火山圖+散點圖

    今天來給大家分享的是:怎么一行命令完成RNAseq數(shù)據(jù)差異分析+火山圖+散點圖丰涉。 一兑牡、準(zhǔn)備3個文件: 1习贫、基因表達count文件:gene_co...

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    seaborn.heatmap的初步學(xué)習(xí)

    參考官網(wǎng)教程诀紊,首先看看seaborn.heatmap的函數(shù)定義形式 numpy數(shù)組繪制熱圖 隨機創(chuàng)建10行12列的數(shù)組巍杈,定義一個子圖寬高為9和6...

  • python腳本截取fastq序列

    前言 ??最近在學(xué)習(xí)單細胞方面的知識闺金,遇到了一個小的需求就是截取需要的fastq序列拒课。先來說一下為什么有這個需求狼牺,一般來說單細胞的測序文件有三個...

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    R語言用列數(shù)據(jù)畫PCA帶橢圓圖

    之前找了很多信息羡儿,見到的都是用行畫PCA,用列的大多都是使用fviz_pca_var這個函數(shù)是钥,但這個函數(shù)橢圓我又死活加不上掠归,再加上畫橢圓時的分組...

    0.3 清珺 1 3
  • python處理fasta文件序列

    1.獲取給定DNA序列的反向互補序列: 思路:從一個文件中導(dǎo)入序列,然后將互補后的結(jié)果輸出到另外一個文件中悄泥。先定義的一個字典: compl...

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    當(dāng)物種組成柱狀圖配上聚類數(shù)

    前兩天在公眾號植物與根際微生物生態(tài)看到一篇轉(zhuǎn)載的文章虏冻,關(guān)于聚類與物種組成柱狀圖的: 翻看了作者的代碼,基本是用R base寫的弹囚,我想著能不能用Y...

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    R package:circlize環(huán)狀熱圖

    1.讀取基因表達數(shù)據(jù) 這是我的基因表達量數(shù)據(jù) 1.1提取部分?jǐn)?shù)據(jù)集 1.2提取基因表達值所在的列厨相,組成新的矩陣,并將矩陣轉(zhuǎn)置 為什么要轉(zhuǎn)置鸥鹉,參考...

    1.7 佳名 1 22
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    R數(shù)據(jù)可視化11:相關(guān)性圖

    之前我們用熱圖的形式展現(xiàn)了相關(guān)關(guān)系蛮穿,今天我們來用另外幾種形式來展現(xiàn)相關(guān)關(guān)系的圖。本文代碼來源:Visualize correlation mat...

    9.3 jlyq617 4 89
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    PCA在R語言中的實現(xiàn)

    PCA 簡介 PCA(Principal Component Analysis)毁渗,即主成分分析践磅。PCA是一種研究數(shù)據(jù)相似性或差異性的可視化方法,...

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    群體遺傳學(xué)與重測序分析

    分子層面對生物的研究灸异,在個體水平上主要是看單個基因的變化以及全轉(zhuǎn)錄本的變化(RNA-seq)府适;在對個體的研究的基礎(chǔ)上羔飞,開始了群體水平的研究。如果...

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生物信息學(xué)

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