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收錄了13篇文章 · 16人關(guān)注
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    基因組大小

    用Kb (千)统倒,Mb(百萬)、Gb(十億)為單位描述基因組的大小氛雪。 bp = base pair(s)=一個堿基對 kb (= kbp) = k...

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    宏基因組數(shù)據(jù)分析流程代碼

    熊金波實驗室出品 整理歸納:Larry 本次學(xué)習(xí)使用的服務(wù)器IP地址和其用戶名賬戶密碼如下: 地址:gs0.genek.tv 用戶名:u3276...

  • breakdancer-CNV

    在安裝時,使用conda 進行安裝报亩, conda install -y breakdancer 安裝完,運行 bin/bam2cfg.pl 報錯...

  • 滑動窗口弦追,并計算每一個窗口的SNP個數(shù)

    數(shù)據(jù)類型 輸出結(jié)果

    0.1 余繞 0 1
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    circos使用筆記

    circos是用來展示數(shù)據(jù)的繪圖工具,其數(shù)據(jù)展示方式主要通過配置文件來決定劲件。不同的展示方式可通過不同的配置文件來進行設(shè)置掸哑,如染色體整體展示,添加...

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    Python3 提取CDS

    根據(jù)物種基因組和注釋文件苗分,可以編寫腳本,提取特殊的序列結(jié)構(gòu)牵辣,完成個性化的分析俭嘁。本文利用Python3提取擬南芥的最長編碼序列,并轉(zhuǎn)化為氨基酸序列...

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    如何上傳轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)到NCBI的SRA數(shù)據(jù)庫

    建議大家把數(shù)據(jù)上傳到我們自己的數(shù)據(jù)庫(http://bigd.big.ac.cn/)服猪,支持國產(chǎn)。由于我的數(shù)據(jù)太差了拐云,還是傳到NCBI吧~ 第一步...

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    RNAseq 必讀綜述和在線教程

    最近讀到一篇博文罢猪,介紹了學(xué)習(xí) RNAseq 數(shù)據(jù)分析非常推薦的兩篇綜述和七個在線教程并發(fā)表了相關(guān)評論。本文將進行簡要整理并對相關(guān)評論內(nèi)容進行大致...

  • 國內(nèi)第一篇植物單細胞測序

    之前關(guān)注王佳偉在植物發(fā)育階段轉(zhuǎn)變過程中調(diào)控機制的研究膳帕,洲更在生信界也是大名頂頂,不知道他們是一個課題組的薇缅。用到的統(tǒng)計方法有:t-SNE和UMAP...

  • windows 下的blast+安裝以及使用

    blast+的安裝 1.程序下載:訪問blast本地軟件包鏈接 blast_latest下載適合自己系統(tǒng)的blast版本危彩。2.安裝流程:下載完畢...

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