alignments 代表比對上的兩個序列hits 表示兩個序列比對上的片段Score 比對得分蟀苛，如果序列匹配上得分掘剪，不一樣，減分墅冷，分值越高仇冯，兩...
投稿
收錄了10篇文章 · 6人關(guān)注
-
關(guān)于blast結(jié)果的一點解讀
-
這或許是我寫的最全的BLAST教程Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tbl...
-
基因的啟動子进萄、UTR、TSS等區(qū)域基因的pomoter區(qū)域：首先在NCBI中查找基因id磁玉，顯示location的位置停忿； 該位置對應(yīng)到轉(zhuǎn)錄水平，應(yīng)該是從TTS（即5' UTR的起始...
-
用blast進行短序列（20nt左右）的搜索
一句話概括就是：blastn多加上-task blastn-short -word_size 7 -evalue 1就ok了蚊伞。 這段時間用bla...
-
本地化BLAST+詳細使用方法
序列相似性搜索是重要的生物信息學(xué)研究之一席赂，常常為新測序基因組或序列片段的功能提供參考，而BLAST是這一系列工具中最流行的相似性搜索工具时迫。198...
-
參考基因組及注釋下載
現(xiàn)有比對工具在做mapping之前颅停，都需要下載對應(yīng)物種的參考基因組做index，而如何選擇合適的參考基因組是一件非常重要的事情掠拳。 現(xiàn)有的參考基因...
-
blast與blast+使用（參數(shù)癞揉、輸出文件格式）
一、BLAST+（NCBI發(fā)布于2009年） 下載地址：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executabl...
-
根據(jù)基因組fa文件和gff文件提取cds并翻譯成pep
cds文件：注釋信息里的蛋白編碼序列pep文件：cds對應(yīng)序列翻譯成的氨基酸序列從NCBI上下載基因組時溺欧，有的并沒有上傳cds文件和pep文件喊熟，...
-
本地化的NCBI BLAST+的安裝及使用
在生物信息學(xué)，BLAST(基本的局部比對搜索工具)是一種算法姐刁，用于比較生物的序列信息芥牌，諸如蛋白質(zhì)的氨基酸序列、DNA或RNA核苷酸序列聂使。BLAS...
-
同源染色體片段檢測工具ColinearScan的使用寫在前面 更好的閱讀體驗請移步這里壁拉。確定染色體同源片段是基因組學(xué)研究的一個重要方面，有助于揭示基因組在歷史上發(fā)生的多種多樣的進化事件柏靶，如DNA復(fù)...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1876144/G____41WO%29%29N%29IURJ12_H%28T.png', '推薦專題《同源基因檢測???》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.reibang.com/c/a07e4b08891a?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認gb2312'));){kind=link}