在命令行中運(yùn)行R腳本撼泛，可以使用Rscript practice.R的方式狭园，其中practice.R是我們希望運(yùn)行的腳本锐借。在Linux和Unix系...

1. 注釋開放區(qū)域 將已識(shí)別的無核小體區(qū)域與基因組特征（如基因和增強(qiáng)子）相關(guān)聯(lián)通常很有趣荔茬。 一旦注釋到基因或增強(qiáng)子的基因霸琴，我們就可以開始將 AT...

1. 結(jié)果處理 現(xiàn)在我們已經(jīng)處理了 Greenleaf ATACseq 雙端數(shù)據(jù)雄家，我們可以開始處理比對(duì)氮双。 首先碰酝，我們將確定 ATACseq 數(shù)據(jù)...

軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] ...

0.質(zhì)控 1.建立亞硫酸鹽基因組index 2. 比對(duì) 輸出結(jié)果有兩個(gè)重要文件暖释，一個(gè)bismark_bt2_PE_report.txt袭厂，一個(gè)bi...

在《WGBS 全基因組甲基化測(cè)序》)講解了 WGBS 測(cè)序原理，簡(jiǎn)而言之是 BS 處理將未甲基化 C 轉(zhuǎn)化為 U(T) 而甲基化的 C 不變球匕，從...

Bismark是進(jìn)行甲基化分析過程中常用到的軟件纹磺，可以將bisulfite處理后的測(cè)序reads比對(duì)到參考基因組上，得到參考基因組相應(yīng)位置的甲基...

作者：馬可菠蘿 童蒙編輯：angelica 一亮曹、甲基化文庫建庫原理 借助重亞硫酸鹽（Bisulfite）轉(zhuǎn)換的方法被認(rèn)為是金標(biāo)準(zhǔn)橄杨，該化學(xué)試劑會(huì)將...