R breeding - 專題 - 簡(jiǎn)書

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R breeding

收錄了17篇文章 · 14人關(guān)注

#asreml #error asr_multinomial() Errors in GLM.
Invalid Binomial/mltinomial proportion ,2.000000/1.000000 in record 559E...

0.1 董八七 2 1
R求解混合線性模型
1腐泻、R包想用R語(yǔ)言進(jìn)行混合線性模型的求解废赞，發(fā)現(xiàn)有很多包屑柔。 Asreml-R 但是要錢魄揉，沒有sommerlme4rrblup 返回BLUE庆械， B...

0.4 KK_f2d5 0 4

系譜重建 colony 使用指南
最近在用Colony铛纬，和Cervus有所區(qū)別嫉戚。下面是翻譯自Colony的用戶指南蹬挺，供理解學(xué)習(xí)维贺。軟件下載地址官方COLONY | Zoologic...

0.4 董八七 5 5
【GWAS】關(guān)聯(lián)分析中踩坑攻略
問題全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）已經(jīng)是應(yīng)用非常普遍的功能基因篩查方法了。但是GWAS 分析仍不可避免的存在一些缺陷巴帮，其中最大的坑有以下幾點(diǎn)： ...

0.6 正蹤大米飯兒 2 12
GPOPSIM軟件介紹
GPOPSIM軟件: https://github.com/SCAU-AnimalGenetics/GPOPSIM 下載摘要背景:基于群體的...

0.1 育種數(shù)據(jù)分析之放飛自我 0 1
去回歸育種值（Deregressed EBV）的計(jì)算
去回歸是一種去除方差異質(zhì)性的方法溯泣，在某類數(shù)據(jù)處理時(shí)偶爾用到，比如估計(jì)基因組選擇育種值時(shí)晰韵。借著文獻(xiàn)Thistlethwaite2019[1]來(lái)學(xué)習(xí)...

1.0 董八七 0 9
PIBLUP：一款高效處理動(dòng)植物基因組大數(shù)據(jù)的GS軟件
PIBLUP：一款高效處理動(dòng)植物基因組大數(shù)據(jù)的GS軟件近期发乔，中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)劉劍鋒老師課題組，在Frontiers in Genetics（IF：...

0.3 育種數(shù)據(jù)分析之放飛自我 0 3

全基因組選擇的定義
定義基因組選擇的最基本思路：在基因組中存在大量遺傳標(biāo)記(SNP)雪猪，影響性狀的所有基因都至少與一個(gè)標(biāo)記緊密連鎖栏尚。因此通過(guò)對(duì)所有標(biāo)記效應(yīng)的估計(jì)，實(shí)現(xiàn)...

0.4 育種數(shù)據(jù)分析之放飛自我 0 7
全基因組選擇中交叉驗(yàn)證選擇的策略
全基因組選擇中交叉驗(yàn)證選擇的策略 Assessment of Cross-validation Strategies for Genomic P...

0.4 育種數(shù)據(jù)分析之放飛自我 0 6
#rstats 生長(zhǎng)曲線只恨、生長(zhǎng)方程译仗、邏輯斯蒂與nls R_square
我本身不做生長(zhǎng)方程擬合，而身邊常有官觅。擬合模型時(shí)在初始值選擇上常遇見困難纵菌，時(shí)而成功，時(shí)而報(bào)錯(cuò)休涤。該怎么選擇初始值咱圆？更新：經(jīng)@木?[https://...

0.5 董八七 4 2