轉(zhuǎn)眼又臨近畢業(yè)季,離別是總會到來的腥刹,但也可以選擇留下點(diǎn)什么,如題祠墅。 考慮到大家都非常忙埃仪,有的甚至還在熬夜寫基金,為此我也長話短說债查。 對于做序列分...
標(biāo)簽:生信分析非区,系統(tǒng)發(fā)育,進(jìn)化樹 RaxML是最大似然法(ML法)建樹的經(jīng)典軟件盹廷,可以建有根樹征绸,支持服務(wù)器上多線程運(yùn)行。而且RaxML是目前為數(shù)...
標(biāo)簽:生信分析俄占,系統(tǒng)發(fā)育 背景:RDP是一款檢測重組或重配的軟件管怠,適用于Windows 95/98/NT/XP/VISTA系統(tǒng)的軟件(其實(shí)w...
很多時(shí)候,我們需要尋找或者篩選某條序列中存在的重復(fù)片段缸榄,同時(shí)我們事先也不知道有哪些重復(fù)片段渤弛,以及它們的長度。 相比與其他軟件甚带,我更喜歡BioAi...
無論是小尺度(少量)的序列集,還是大尺度(大量)的序列集鹰贵,無論是基因片段的突變分析辕宏,還是全基因組的突變分析。 又或者砾莱,序列為非編碼基因瑞筐,或非編碼...
多重序列比對(Multiple-Sequence-Alignment , MSA)應(yīng)該是序列分析中最為基礎(chǔ)的操作了,筆者之前發(fā)了很大筆墨介紹了M...
在進(jìn)行序列分析時(shí)聚假,難免要做一張序列兩兩比較的同一性(大致和相似性差不多)表块蚌,比如下面這樣的: 單一核苷酸或者氨基酸序列同一性表比較好辦,可以通過...
以病毒為例膘格,病毒經(jīng)常發(fā)生跨宿主傳播峭范,主要發(fā)生在近緣物種之間 。許多人類病毒流行病是由動(dòng)物跨宿主傳播而來瘪贱,如SARS纱控、MERS、高致病性禽流...
Beast是用來進(jìn)行貝葉斯MCMC分析的一系列合集軟件菜秦,其主要組成程序有BEAUti甜害、BEAST、Tracer球昨、TreeAnnotator尔店、...