前一段時(shí)間進(jìn)行了Bayes培訓(xùn)晦款,所以想總結(jié)和進(jìn)一步學(xué)習(xí)Bayes方法桂躏。主要是用來估計(jì)SNP的效應(yīng)(GWAS)和應(yīng)用不同生物信息給SNP權(quán)重驼唱,提高...
翻譯來自Fatma Yardibi等的最新文章“The trend of breeding value research in animal s...
本篇是翻譯Andres Legarra的博客劳殖。 數(shù)值分析的縮放(或者說標(biāo)準(zhǔn)化)特征和方差分量估計(jì)等去縮放(即還原)結(jié)果可能令人頭疼彤委。 這里給出如...
來自Gentore培訓(xùn)(奧胡斯大學(xué)鞭铆,Emre Karaman,2022/6/29) 目的:對(duì)雜交動(dòng)物做GP 目錄 1 基因組估計(jì) 前基因組世代:...
來自Gentore項(xiàng)目培訓(xùn)(奧胡斯大學(xué),Ana Guilenea葫慎,2022/6/29) 目錄 1 介紹 1.1 基因組數(shù)據(jù) 等位基因 二倍體基因...
LR方法創(chuàng)建者:Legarra, A., Reverter, A., 其發(fā)表在GSE期刊:https://gsejournal.biomedce...
目錄 1 內(nèi)存 2 近交 獲得多樣性的總體衡量標(biāo)準(zhǔn)衔彻。 近交系數(shù) —— Fi 近交系數(shù)可以監(jiān)測(cè)遺傳多樣性和獲得準(zhǔn)確的準(zhǔn)確性。A和G矩陣的 Fi計(jì)算...
ssGBLUP經(jīng)過10多年的發(fā)展偷办,已經(jīng)普遍開始應(yīng)用在動(dòng)物育種中艰额。 以前的多步法 基因組評(píng)估 問題: 表型的測(cè)量 BLUP會(huì)低估基因組選擇趨勢(shì) 一...
1 GWAS的目錄 歷史 來自 (ss)GBLUP 單SNP回歸 求解SNP效應(yīng)使用 GWAS的一些細(xì)節(jié) 2 遺傳評(píng)估中的非加性效應(yīng) 來自Zul...