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Seurat繪制單細(xì)胞千里江山圖（山巒圖）山巒圖，英文名叫做ridge plot，其本質(zhì)上是密度圖（density plot）,其實(shí)中文并沒有統(tǒng)一的稱呼岭洲，但是由于其外貌高低不平，形似山川...
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雷達(dá)圖在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用聽過周老師的課的同學(xué)，應(yīng)該有印象：周老師在講單細(xì)胞數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的時(shí)候提到過擂达，單細(xì)胞數(shù)據(jù)是表達(dá)量數(shù)據(jù)，每個(gè)數(shù)值表示的是表達(dá)量涣狗，也就是含量谍婉，是一個(gè)非負(fù)數(shù)...
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Seurat Weekly NO.17 || 一個(gè)R包的CNS之路seurat發(fā)展歷史舒憾，cns之路 在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中，特別是對初學(xué)者來說穗熬，Seurat是一個(gè)教科書級別的工具镀迂。至于這個(gè)用來分析單細(xì)胞多組學(xué)的工具...
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Seurat Weekly NO.14 || 讀源碼解決實(shí)際問題
天子呼來不上船，自稱臣是菜鳥團(tuán)唤蔗。 在這里探遵，和國際同行一起學(xué)習(xí)單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析。 我今天并沒有敲滿100行代碼妓柜，以至于我在寫這篇文章的時(shí)候都有點(diǎn)不好...
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Seurat Weekly NO.13 || 依賴關(guān)系與維護(hù)天子呼來不上船箱季，自稱臣是菜鳥團(tuán)。 在這里棍掐，和國際同行一起學(xué)習(xí)單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析藏雏。 最近在R4上安裝Seurat V4 的時(shí)候，有可能會遇到這樣的報(bào)錯(cuò)...
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Seurat Weekly NO.12 ||205頁的教程天子呼來不上船作煌，自稱臣是菜鳥團(tuán)掘殴。 在這里，和國際同行一起學(xué)習(xí)單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析粟誓。 Seurat V4 的教程頁面做了全面的改進(jìn)奏寨，用pkgdown構(gòu)建...
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Seurat Weekly NO.11 ||預(yù)告2021 Single Cell Genomics Day在這里，和國際同行一起學(xué)習(xí)單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析鹰服。 還記得2019年上的第一門比較完整和前沿的課程是Suerat團(tuán)隊(duì)的Single Cell Genom...
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Seurat對象中NicheNet分析以及circos可視化在這篇短文中病瞳，您可以學(xué)習(xí)如何在Seurat v3對象上執(zhí)行基本的NicheNet分析，以及如何在circos圖中可視化輸出悲酷。值得注意的是套菜，我們作...
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circos圖在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用前情回顧： Network在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用[http://www.reibang.com/p/23e46ad14a3e]桑基圖在...
