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bam文件解讀二代測序： 1：該read是成對的paired reads中的一個2：paired reads中每個都正確比對到參考序列上4：該read沒比對到...
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常用的一些linux基礎命令
各位看官老爺們大家好，俗話說抖苦，萬丈高樓平地起，今天就帶大家學習下生物信息學習過程經(jīng)常用到的最基礎但也是最實用的一些linux命令炎咖，當你的小伙伴們...
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GWAS-與復雜疾病性狀相關的遺傳因素研究方法
基于當前流行病學研究的進展及研究熱點芳誓，在這里為大家簡單介紹一下關于全基因組關聯(lián)研究（Genome-wide association study，...
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基因組學發(fā)展歷史-前奏1665 年,英國的物理學家胡克發(fā)現(xiàn)細胞兔簇，從此人們觀察到了繽紛的微觀世界发绢。 1859年，達爾文發(fā)表《物種起源》垄琐，并提出物種會因適應環(huán)境變化的特征...
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單體型圖譜簡介（3）群體結(jié)構(gòu)分析 在一個大群體中边酒，不同的個體之間群體結(jié)構(gòu)是存在差異的，換句話說就是不同個體的遺傳物質(zhì)來自不同的祖先狸窘。 系統(tǒng)發(fā)生樹分析 通過Mega或...
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單體型圖譜簡介（2）Tag SNP 理論上墩朦，研究者通過對全部一千萬個SNP位點都進行基因分型，也能夠?qū)ふ业竭@樣的區(qū)域翻擒。但是氓涣，目前用這種方法進行檢定的成本是過于昂貴。...
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單體型圖譜簡介（1）單體型概念及起源 單體型的概念 一個染色體區(qū)域中所有相關聯(lián)的SNP等位基因的集合或位于染色體上某一區(qū)域的一組相關聯(lián)的SNP等位位點被稱為一個單體...
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基因組surey簡介基因組的復雜程度直接決定了物種的組裝難度陋气，已測序物種的基因組大小從幾百個基因（支原體Mycoplasma mycoides劳吠。 它的最小基因組由4...
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RNA-seq 分析常用的軟件如果所研究的物種有組裝注釋質(zhì)量較好基因組序列，且和該基因組序列比對效率較高巩趁，那么可以采用有參轉(zhuǎn)錄組的分析策略痒玩，直接進行分析。反之议慰，則需要按照無參...