WB實(shí)驗(yàn)問(wèn)題總結(jié)(Western blot蛋白質(zhì)印跡)

1.為什么我的細(xì)胞提取液中沒(méi)有目標(biāo)蛋白?

答:原因有很多:

a) 你的細(xì)胞中不表達(dá)這種蛋白質(zhì)沛厨,換一種細(xì)胞刚照;

b) 你的細(xì)胞中的蛋白質(zhì)被降解掉了刑巧,你必需加入PMSF,抑制蛋白酶活性无畔;

c) 你的抗體不能識(shí)別目標(biāo)蛋白啊楚,多看看說(shuō)明,看是否有問(wèn)題浑彰。

2.我的細(xì)胞提取液有的有沉淀恭理,有的很清亮,為什么呢郭变?

答:a) 有沉淀可能因?yàn)槟愕牡鞍讻](méi)有變性完全颜价,可以適當(dāng)提高SDS 濃度,同時(shí)將樣品煮沸時(shí)間延長(zhǎng)诉濒;

b) 也不排除你的抗原濃度過(guò)高周伦,這時(shí)再加入適量上樣緩沖液即可。

3.我做的蛋白質(zhì)分子量很小(10KD),請(qǐng)問(wèn)怎么做WB未荒?

答:可以選擇0.2μml的膜专挪,同時(shí)縮短轉(zhuǎn)移時(shí)間。也可以將兩張膜疊在一起茄猫,再轉(zhuǎn)移狈蚤。其他按步驟即可。

4.我的目的帶很弱划纽,怎么加強(qiáng)脆侮?

答:可以加大抗原上樣量。這是最主要的勇劣。同時(shí)也可以將一抗稀釋比例降低靖避。

5.膠片背景很臟,有什么解決方法比默?

答:減少抗原上樣量幻捏,降低一抗?jié)舛龋淖円豢狗跤龝r(shí)間命咐,提高牛奶濃度篡九。?

6.目標(biāo)帶是空白,周圍有背景醋奠,是為什么榛臼?

答:你的一抗?jié)舛容^高伊佃,二抗上HRP 催化活力太強(qiáng),同時(shí)你的顯色底物處于一個(gè)臨界點(diǎn)沛善,反應(yīng)時(shí)間不長(zhǎng)航揉,將周圍底物催化完,形成了空白即“反亮現(xiàn)象”金刁。將一抗和二抗?jié)舛冉档退浚蚋鼡Q新底物。

7.我的膠片是一片空白尤蛮,是怎么回事媳友?

答:如果能夠排除下面的幾個(gè)問(wèn)題那么問(wèn)題多半出現(xiàn)在一抗和抗原制備上。

a) 二抗的HRP 活性太強(qiáng)抵屿,將底物消耗光庆锦;

b) ECM底物中H2O2捅位,不穩(wěn)定轧葛,失活;

c) ECL底物沒(méi)覆蓋到相應(yīng)位置艇搀;

d) 二抗失活尿扯。

8.我在顯影液中顯影1分鐘和5分鐘后,底片漆黑一片

是什么原因呢?

答:a) 可能是紅燈造成的, 膠片本來(lái)就被曝光了,可以在完全黑暗的情況下操作.看是否有改善焰雕;

b) 顯影時(shí)間過(guò)長(zhǎng)衷笋。

9.DAB好還是ECM好?

答:DAB 有毒矩屁,但是比較靈敏辟宗,是HRP 最敏感的底物;ECM結(jié)果容易控制吝秕,但被催化時(shí)靈敏度差一點(diǎn)泊脐,但如果達(dá)到閥值,就特別靈敏烁峭,可以檢測(cè)pg 級(jí)抗原容客。要看你實(shí)驗(yàn)的情況。


10.抗原檢測(cè)出的分子量比資料上的大约郁,是怎么回事缩挑?

答:a)抗原形成了二聚體。增多巰基乙醇量鬓梅,煮沸變性時(shí)間延長(zhǎng)供置,可以打開(kāi)二聚體;

b)蛋白本身的修飾如:糖基化绽快,磷酸化等芥丧。

11.蛋白轉(zhuǎn)移不到膜上悲关,但膠上有,同時(shí)Marker 轉(zhuǎn)上去了娄柳。為什么寓辱?

答:可能是:

a)樣品濃度過(guò)低;

b)轉(zhuǎn)移時(shí)間不夠赤拒。

12.磷酸化抗體的檢測(cè)樣本制備時(shí)是否一定要加NaF等秫筏?

答:NaF是一種廣譜磷酸化酶的抑制劑肃弟,一般最好加免姿。但是不加也可以乐设,大部分時(shí)候是不用加的瘩蚪。

13.要驗(yàn)證某個(gè)細(xì)胞上有無(wú)該蛋白的存在抖所,需要做免疫組化和western blot試驗(yàn)嗎金吗?做這兩個(gè)試驗(yàn)時(shí)的一抗和二抗可以共用嗎罗珍?

答:① 免疫組化可以用來(lái)進(jìn)行定位糊秆,但是不能精確定量始衅,而且有時(shí)會(huì)有假陽(yáng)性冷蚂,不易與背景區(qū)分;Western blot可以特異性檢測(cè)某個(gè)蛋白質(zhì)分子汛闸,進(jìn)行定量蝙茶,但是不能定位。

② 兩種實(shí)驗(yàn)的一抗有時(shí)候不能通用诸老,公司的產(chǎn)品說(shuō)明一般都會(huì)說(shuō)明可以進(jìn)行什么實(shí)驗(yàn)隆夯,在免疫組化時(shí),是否適合石蠟切片或者冰凍切片别伏。

14.電泳中常出現(xiàn)的一些現(xiàn)象

︶ 條帶呈笑臉狀

原因:凝膠不均勻冷卻,中間冷卻不好; 電泳系統(tǒng)溫度偏高厘肮。

︵ 條帶呈皺眉狀

原因:可能是由于裝置不合適愧口,特別可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或者兩邊聚合不完全轴脐。

拖尾

原因:樣品溶解不好调卑。

紋理(縱向條紋)

原因:樣品中含有不溶性顆粒。

條帶偏斜

原因:電極不平衡或者加樣位置偏斜大咱。

條帶兩邊擴(kuò)散

原因:加樣量過(guò)多恬涧。


15.Western blot結(jié)果中背景較高可能的原因及建議

膜封閉不夠

延長(zhǎng)封閉的時(shí)間;選擇更加適合的封閉液碴巾。

一抗稀釋度不適宜

對(duì)抗體進(jìn)行滴度測(cè)試溯捆,選擇最適宜的抗體稀釋度。

一抗孵育的溫度偏高

建議4℃結(jié)合過(guò)夜。

選擇的膜容易產(chǎn)生高背景

一般硝酸纖維素膜的背景會(huì)比PVDF膜低提揍。

膜在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中干過(guò)

實(shí)驗(yàn)過(guò)程中要注意保持膜的濕潤(rùn)啤月。

檢測(cè)時(shí)曝光時(shí)間過(guò)長(zhǎng)

減少曝光時(shí)間。

16.?Western blot結(jié)果中雜帶較多可能的原因及建議

目的蛋白有多個(gè)修飾位點(diǎn)(磷酸化位點(diǎn)劳跃、糖基化位點(diǎn)谎仲、乙酰化位點(diǎn)等)刨仑,本身可以呈現(xiàn)多條帶郑诺。

查閱文獻(xiàn)或進(jìn)行生物信息學(xué)分析,獲得蛋白序列的修飾位點(diǎn)信息杉武,通過(guò)去修飾確定蛋白實(shí)際大小辙诞。

目的蛋白有其它剪切本

查閱文獻(xiàn)或生物信息學(xué)分析可能性。

樣本處理過(guò)程中目的蛋白發(fā)生降解

加入蛋白酶抑制劑轻抱;樣本處理時(shí)在冰上操作飞涂。

上樣量過(guò)高,太敏感

適當(dāng)減少上樣量祈搜。

一抗特異性不高

重新選擇或制備高特異性的抗體较店。

一抗不純

純化抗體

一抗或者二抗?jié)舛绕?/p>

降低抗體濃度。


17.Western?blot結(jié)果中無(wú)信號(hào)或顯示信號(hào)弱

可能的原因及建議

檢測(cè)樣本不表達(dá)目的蛋白

選擇表達(dá)量高的細(xì)胞作為陽(yáng)性對(duì)照夭问,用于確定檢測(cè)樣本是否為陰性泽西。

檢測(cè)樣本低表達(dá)目的蛋白

提高上樣量曹铃,裂解液中注意加入蛋白酶抑制劑缰趋。

轉(zhuǎn)移不完全或過(guò)轉(zhuǎn)移

可以用麗春紅染膜并結(jié)合染膠(考馬斯亮藍(lán))后確定條帶是否轉(zhuǎn)至膜上或轉(zhuǎn)移過(guò)頭;適當(dāng)調(diào)整轉(zhuǎn)膜的時(shí)間和電流陕见。

抗體不能識(shí)別測(cè)試種屬的相關(guān)蛋白

購(gòu)買抗體前應(yīng)當(dāng)認(rèn)真閱讀抗體說(shuō)明書(shū)秘血,確定其是否能夠交叉識(shí)別測(cè)試種屬的對(duì)應(yīng)蛋白。

一抗孵育時(shí)間不足

建議4℃結(jié)合過(guò)夜评甜。

二抗與一抗不匹配

選擇針對(duì)一抗來(lái)源的種屬的抗體灰粮。

洗膜過(guò)度

洗膜時(shí)間不宜過(guò)長(zhǎng),加入的去垢劑不宜過(guò)強(qiáng)或過(guò)多忍坷,建議使用0.1%的弱去垢劑Tween-20粘舟。


18.其它現(xiàn)象

膜上多處出現(xiàn)黑點(diǎn)或黑斑

原因:抗體與封閉試劑發(fā)生非特異性的結(jié)合。

反白(條帶顯白色)

原因:目的蛋白含量太高或者一抗?jié)舛绕摺?/p>

蛋白分子量偏低或偏高

原因:膠濃度不適合佩研,高分子量要用低濃度膠柑肴;小分子蛋白要用高濃度膠。

19.安全問(wèn)題

操作有毒試劑時(shí)旬薯,帶手套和口罩晰骑,且操作揮發(fā)性試劑應(yīng)在通風(fēng)櫥中進(jìn)行。


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