課件來源：7.3.1 真核生物的轉(zhuǎn)錄過程（1）_嗶哩嗶哩_bilibili
大綱
三種RNA聚合酶
不同RNA聚合酶識別不同啟動子
需要TFs的幫助
1. 與原核生物的差異
2. RNA聚合酶Ⅰ的啟動子
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名詞解釋：
多拷貝基因（multigene）是指在基因組中存在多個相同或高度相似的基因序列多望。這些基因通常是通過基因復(fù)制事件產(chǎn)生的苞氮，可以是串聯(lián)重復(fù)（在染色體上相鄰排列）或散布在整個基因組中。多拷貝基因在生物學(xué)中具有多種功能和意義：
- 基因表達的調(diào)控：多拷貝基因可以增加特定蛋白的表達量缓溅，以滿足細(xì)胞在特定條件下對這些蛋白的需求。
- 適應(yīng)性進化：多拷貝基因為物種提供了更多的遺傳變異，有助于物種適應(yīng)環(huán)境變化。
- 基因冗余：多拷貝基因提供了一定程度的基因冗余葫慎，即使某些基因拷貝發(fā)生突變或丟失，其他拷貝仍然可以維持基本的生物學(xué)功能薇宠。
- 新功能的出現(xiàn)：多拷貝基因中的某些拷貝可能通過突變獲得新的功能偷办，參與新的生物學(xué)過程。
- 劑量效應(yīng)：多拷貝基因可以影響基因的表達劑量澄港，對細(xì)胞功能和個體表型產(chǎn)生影響椒涯。
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基因組的穩(wěn)定性：多拷貝基因可能參與維持基因組的穩(wěn)定性，例如通過同源重組修復(fù)DNA損傷回梧。
多拷貝基因的研究有助于我們理解基因組的復(fù)雜性废岂、基因表達的調(diào)控機制以及物種的進化過程。
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上游控制元件（Upstream Control Element狱意，簡稱UCE）是真核生物啟動子中的一個重要組成部分湖苞，它們位于啟動子的核心元件（如TATA框）的上游區(qū)域。上游控制元件對啟動子的轉(zhuǎn)錄活性具有調(diào)控作用详囤，可以影響基因的表達水平财骨。以下是上游控制元件的一些關(guān)鍵點：
- 位置：上游控制元件通常位于轉(zhuǎn)錄起始位點的上游區(qū)域，具體位置可能因基因和物種而異。
- 功能：它們通過與特定的轉(zhuǎn)錄因子（Transcription Factors隆箩，TF）結(jié)合滑肉，增強或抑制核心啟動子的轉(zhuǎn)錄活性，從而調(diào)控基因的表達摘仅。
- 包含的元件：上游控制元件包括多種順式作用元件，如CAAT框问畅、GC框娃属、八聚體框（Octamer motif）等，這些元件具有特定的核苷酸序列护姆，能夠被相應(yīng)的轉(zhuǎn)錄因子識別并結(jié)合矾端。
- 增強子：上游控制元件中的增強子可以位于基因的上游或下游，甚至在另一個染色體上卵皂，它們通過與增強子結(jié)合蛋白相互作用秩铆，遠程調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄。
- 特異性：上游控制元件具有一定的種族特異性灯变，即它們在不同物種中可能具有不同的序列和結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子殴玛，從而影響基因表達的組織特異性和發(fā)育階段特異性。
- 影響因素：上游控制元件的活性可能受到多種因素的影響添祸，包括轉(zhuǎn)錄因子的濃度滚粟、細(xì)胞類型、發(fā)育階段和環(huán)境信號等刃泌。
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與RNA聚合酶的相互作用：在某些情況下凡壤，上游控制元件可以直接與RNA聚合酶或其輔助因子相互作用，影響聚合酶的定位和轉(zhuǎn)錄起始的效率耙替。
上游控制元件在基因表達調(diào)控中起著至關(guān)重要的作用亚侠，它們使得基因表達能夠?qū)?fù)雜的細(xì)胞內(nèi)和細(xì)胞外信號做出精細(xì)的響應(yīng)。
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核心啟動子的特點是必須要有它才能轉(zhuǎn)錄俗扇，但是不代表轉(zhuǎn)錄的水平高低硝烂，只是一個基本的轉(zhuǎn)錄。
UCE可以控制表達的高低狐援，有它表達就高钢坦，沒有就比較低。但是有種族特異性啥酱，即使基因重組轉(zhuǎn)入別的物種也不生效爹凹。
距離說明增加一兩個堿基對啟動子影響不大，但是刪除就很影響了镶殷。
如何理解禾酱？
可以用"電器和電源開關(guān)"的比喻來形象說明核心啟動子和 UCE的關(guān)系：
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核心啟動子 = 電源開關(guān)
核心啟動子就像一個電器的電源開關(guān)，它的作用是讓設(shè)備啟動。- 如果沒有這個開關(guān)（核心啟動子）颤陶，設(shè)備就根本無法運轉(zhuǎn)（沒有轉(zhuǎn)錄發(fā)生）颗管。
- 但是，有了開關(guān)只是確保設(shè)備能被打開滓走，不一定意味著設(shè)備會工作得很好（轉(zhuǎn)錄的水平可能很低）垦江。
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UCE = 調(diào)節(jié)旋鈕
UCE 就像設(shè)備上的調(diào)節(jié)旋鈕或檔位調(diào)節(jié)器，它決定設(shè)備運行的效率或強度搅方。- 如果有調(diào)節(jié)旋鈕（UCE）比吭，設(shè)備可以運轉(zhuǎn)得更高效（高轉(zhuǎn)錄水平）。
- 如果沒有調(diào)節(jié)旋鈕姨涡，設(shè)備也能運行（基本的轉(zhuǎn)錄水平）衩藤，但效率較低（表達水平低）。
綜合起來：
- 核心啟動子 = 保證基本運作（開關(guān)必不可少）涛漂。
- UCE = 決定性能高低（有它更高效赏表，沒有也能基本運行）。
就像一盞燈：開關(guān)（核心啟動子）決定燈能不能亮匈仗，而調(diào)光旋鈕（UCE）決定燈的亮度高低瓢剿。
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