數(shù)據(jù)準(zhǔn)備：
1.下載物種的基因注釋文件铅歼、cds文件、以及蛋白質(zhì)文件换可。(NCBI椎椰、Ensemble、phytozome(JGI)進(jìn)行下載沾鳄，具體下載方法可參考：下載研2.究的基因家族的隱馬可夫模型慨飘。(Pfam中進(jìn)行下載)
梳理流程：
1.查看自己物種的注釋文件、cds文件译荞、以及蛋白質(zhì)文件瓤的。我以石榴為例子。
2.hmmer搜索
3.利用E-value值篩選hmm結(jié)果文件
4.利用SMART磁椒、NCBI、pfam手動(dòng)確認(rèn)結(jié)構(gòu)域
5.
