資料引用
conda安裝
- 添加鏡像
添加鏡像# 使用清華鏡像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
- 過程
cd ~/biosoft
wget 軟件下載網址https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
「for Windows」請記住這里的粘貼不是ctrl+c和ctrl+V了慌植,選中甚牲,鼠標左鍵點一下是復制,右鍵點一下是粘貼蝶柿;
「for Mac」直接cmd + c 復制丈钙,cmd + v粘貼
過程簡單,最后一步需注意
source ~/.bashrc來激活conda
命令行輸入conda交汤,出現(xiàn)滿屏的信息說明成功了
如果報錯雏赦,說明你可能沒有進行上一步的source ~/.bashrc命令。
conda使用
- 查看軟件列表
conda list
- 搜索軟件
conda search fastqc
- 安裝軟件
conda install fastqc -y
- 卸載軟件
conda remove fastqc
- 建立新環(huán)境
conda create -n rna-seq python=3
- 查看conda 環(huán)境
conda info --envs
- 激活conda環(huán)境芙扎,建立新環(huán)境后需激活星岗,不同環(huán)境切換需要執(zhí)行該命令
conda activate 新環(huán)境名
- 刪除環(huán)境
rm -r 文件路徑