單細(xì)胞測(cè)序助力腫瘤免疫治療

之前我們分享了《從單個(gè)細(xì)胞入手的腫瘤研究》模闲,讓我們接著聊聊從單細(xì)胞入手怎樣幫助解析黑色素瘤免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療不良事件的發(fā)生機(jī)制岩睁,并發(fā)現(xiàn)潛在治療靶點(diǎn)。

腫瘤免疫治療是目前該領(lǐng)域最具前景的發(fā)展方向之一。隨著PD-(L)1彭沼、CTLA-4等免疫檢查點(diǎn)抑制劑應(yīng)用范圍逐漸擴(kuò)大,對(duì)復(fù)發(fā)、難治性腫瘤患者表現(xiàn)出了突破性療效祥绞,給更多腫瘤患者帶來(lái)希望。然而近60%的PD-(L)1、CTLA-4聯(lián)合治療患者出現(xiàn)嚴(yán)重的毒性反應(yīng)等不良事件蜕径。腸道炎癥 (checkpoint inhibitor induced colitis两踏,+CPI colitis)是最常見(jiàn)的不良事件,也是停止治療的重要原因兜喻。我們目前對(duì)其發(fā)生及發(fā)展的機(jī)制仍不清楚梦染,如果能夠找到應(yīng)對(duì)的方法將會(huì)大大提高免疫檢查點(diǎn)抑制劑的受益群體。

這篇發(fā)表在《cell》上題為“Molecular Pathways of Colon Inflammation Induced by Cancer Immunotherapy”的文章是如何開(kāi)展相關(guān)研究的呢朴皆?

文章對(duì)黑色素瘤免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療引發(fā)腸道炎癥組帕识、治療無(wú)不良事件對(duì)照組、正常對(duì)照組對(duì)照的腸穿刺樣本(n = 6 +CPI colitis, n = 5 +CPI no colitis, n = 5 control)遂铡,解離單細(xì)胞懸液后分別分選CD45+(白細(xì)胞)和CD3+(T細(xì)胞)免疫細(xì)胞肮疗,進(jìn)行5’轉(zhuǎn)錄組+免疫組庫(kù)單細(xì)胞測(cè)序(圖1),通過(guò)單細(xì)胞數(shù)據(jù)的分析交出了完美的答卷忧便。

圖1:實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路圖

CD45+抗體分選后進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序分析發(fā)現(xiàn)族吻,+CPI colitis組中非常顯著的T細(xì)胞和髓系細(xì)胞富集,而Control組和+CPI no colitis組具有較高的相似性珠增,這表明T細(xì)胞群體的這些變化與疾病狀態(tài)相關(guān)超歌,而不是藥物治療。流式細(xì)胞計(jì)數(shù)對(duì)結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證蒂教。

圖2:CD45+T細(xì)胞單細(xì)胞測(cè)序亞群分析??

接下來(lái)對(duì)CD3+抗體分選細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序巍举,更精準(zhǔn)地分析,CD8+T細(xì)胞組成在+CPI colitis組與兩個(gè)對(duì)照組之間有顯著差異凝垛,具有高度細(xì)胞毒性和增殖狀態(tài)的CD8+T細(xì)胞大量堆積懊悯。并用流式細(xì)胞分析及多色免疫熒光在不同層面進(jìn)行了驗(yàn)證。同樣對(duì)CD4+T細(xì)胞群體也進(jìn)行了分析梦皮,+CPI colitis組與兩個(gè)對(duì)照組相比炭分,同樣存在特異性大量富集的細(xì)胞亞群。調(diào)節(jié)T細(xì)胞(regulatory T cells剑肯,Treg)是一群具有負(fù)調(diào)控免疫反應(yīng)的淋巴細(xì)胞捧毛,之前有研究在小鼠模型中發(fā)現(xiàn),抗CTLA-4免疫治療能夠?qū)е耇reg細(xì)胞的耗竭让网,據(jù)此推論免疫治療不良事件的產(chǎn)生可能與Treg細(xì)胞的耗竭有關(guān)呀忧。而本研究在對(duì)CD4+T細(xì)胞的分析發(fā)現(xiàn),F(xiàn)oxP3+ Treg細(xì)胞比例和FoxP蛋白表達(dá)量在+CPI colitis樣本中均有顯著提升溃睹。Treg細(xì)胞亞群分析也識(shí)別出了+CPI colitis特異性的具有Th1細(xì)胞活性的Treg細(xì)胞亞群而账。這表明免疫檢查點(diǎn)抑制劑引起的腸道炎癥不是由Treg細(xì)胞耗竭導(dǎo)致的,炎性微環(huán)境影響了Treg細(xì)胞的表達(dá)譜因篇。進(jìn)一步對(duì)腸道炎癥相關(guān)T細(xì)胞和髓系細(xì)胞中特異表達(dá)基因進(jìn)行了分析泞辐,INFr和TNFa應(yīng)答基因顯著富集笔横。

圖3:CD8+T細(xì)胞單細(xì)胞測(cè)序亞群分析及流式、多色免疫熒光驗(yàn)證??
圖4:CD4+T細(xì)胞單細(xì)胞測(cè)序亞群分析及流式??

進(jìn)一步對(duì)CD8+T細(xì)胞不同亞群的TCR克隆擴(kuò)增進(jìn)行分析铛碑,發(fā)現(xiàn)+CPI colitis組與兩個(gè)對(duì)照組之間也存在顯著差異狠裹,腸道炎癥相關(guān)CD8+T細(xì)胞有很大一部分來(lái)自于組織駐留記憶T細(xì)胞。

圖5:CD8+T細(xì)胞單細(xì)胞免疫組庫(kù)測(cè)序克隆擴(kuò)增分析??

通過(guò)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組及免疫組庫(kù)數(shù)據(jù)揭示了腸道炎癥這一不良事件的分子發(fā)生機(jī)制汽烦,那么我們據(jù)此再找到潛在治療靶點(diǎn)就完美了。

通過(guò)對(duì)前面得到的數(shù)據(jù)分析揭示趨化因子受體抑制劑莉御、aEb7 撇吞、 a4b7整合抑制劑、TNFa阻斷劑礁叔、IL-1b阻斷劑等均提示具有改善腸道炎癥的潛力牍颈。如趨化因子受體基因CXCR6在+CPI colitis組的T細(xì)胞中高表達(dá),被IFN和TNF信號(hào)通路調(diào)控的CXCR6配體基因CXCL16在髓系細(xì)胞和肥大細(xì)胞中也同樣高表達(dá)琅关。并且CXCR6在多種人類(lèi)腫瘤細(xì)胞中都高表達(dá)煮岁,故以CXCR6作為潛在的治療靶點(diǎn),或可有效改善腸道炎癥涣易。

圖6:T細(xì)胞-髓系細(xì)胞的連接及治療靶標(biāo)分析??

文章首次通過(guò)單細(xì)胞視角對(duì)免疫治療誘導(dǎo)腸炎組和免疫治療画机、正常人兩組對(duì)照的腸穿刺樣本,分別分選免疫細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序新症,揭示了免疫治療誘導(dǎo)腸炎的分子發(fā)生機(jī)制步氏,具有高度細(xì)胞毒性和增殖狀態(tài)的CD8+T細(xì)胞的大量堆積,且沒(méi)有調(diào)節(jié)性T細(xì)胞耗竭的證據(jù)徒爹。TCR序列分析發(fā)現(xiàn)腸炎相關(guān)CD8+T細(xì)胞有很大一部分來(lái)自于組織駐留記憶T細(xì)胞荚醒,這解釋了免疫治療開(kāi)始后腸炎一般較早發(fā)作。對(duì)細(xì)胞因子隆嗅,趨化因子界阁,表面受體的分析發(fā)現(xiàn)他們可以作為免疫檢查點(diǎn)阻斷引起腸炎的治療靶標(biāo)。

最后編輯于
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末胖喳,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市泡躯,隨后出現(xiàn)的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌禀晓,老刑警劉巖精续,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,013評(píng)論 6 481
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異粹懒,居然都是意外死亡重付,警方通過(guò)查閱死者的電腦和手機(jī),發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,205評(píng)論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門(mén)凫乖,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來(lái)确垫,“玉大人弓颈,你說(shuō)我怎么就攤上這事∩鞠疲” “怎么了翔冀?”我有些...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 152,370評(píng)論 0 342
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵,是天一觀(guān)的道長(zhǎng)披泪。 經(jīng)常有香客問(wèn)我纤子,道長(zhǎng),這世上最難降的妖魔是什么款票? 我笑而不...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 55,168評(píng)論 1 278
  • 正文 為了忘掉前任控硼,我火速辦了婚禮,結(jié)果婚禮上艾少,老公的妹妹穿的比我還像新娘卡乾。我一直安慰自己,他們只是感情好缚够,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 64,153評(píng)論 5 371
  • 文/花漫 我一把揭開(kāi)白布幔妨。 她就那樣靜靜地躺著,像睡著了一般谍椅。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪误堡。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上,一...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 48,954評(píng)論 1 283
  • 那天毯辅,我揣著相機(jī)與錄音埂伦,去河邊找鬼。 笑死思恐,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛沾谜,可吹牛的內(nèi)容都是我干的。 我是一名探鬼主播胀莹,決...
    沈念sama閱讀 38,271評(píng)論 3 399
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開(kāi)眼基跑,長(zhǎng)吁一口氣:“原來(lái)是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼!你這毒婦竟也來(lái)了描焰?” 一聲冷哼從身側(cè)響起媳否,我...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 36,916評(píng)論 0 259
  • 序言:老撾萬(wàn)榮一對(duì)情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎荆秦,沒(méi)想到半個(gè)月后篱竭,有當(dāng)?shù)厝嗽跇?shù)林里發(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,382評(píng)論 1 300
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡步绸,尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 35,877評(píng)論 2 323
  • 正文 我和宋清朗相戀三年掺逼,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片瓤介。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 37,989評(píng)論 1 333
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡吕喘,死狀恐怖赘那,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情氯质,我是刑警寧澤募舟,帶...
    沈念sama閱讀 33,624評(píng)論 4 322
  • 正文 年R本政府宣布,位于F島的核電站闻察,受9級(jí)特大地震影響拱礁,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜蜓陌,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 39,209評(píng)論 3 307
  • 文/蒙蒙 一觅彰、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧钮热,春花似錦、人聲如沸烛芬。這莊子的主人今日做“春日...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 30,199評(píng)論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽(yáng)赘娄。三九已至仆潮,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間遣臼,已是汗流浹背性置。 一陣腳步聲響...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 31,418評(píng)論 1 260
  • 我被黑心中介騙來(lái)泰國(guó)打工, 沒(méi)想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留揍堰,地道東北人鹏浅。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 45,401評(píng)論 2 352
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長(zhǎng)得像屏歹,于是被迫代替她去往敵國(guó)和親隐砸。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 42,700評(píng)論 2 345

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容