Nat Med| T細(xì)胞恢復(fù)模型指導(dǎo)免疫治療

原創(chuàng)?huacishu?圖靈基因?2022-05-20 07:03?發(fā)表于江蘇

收錄于合集#前沿生物大數(shù)據(jù)分析

撰文：huacishu

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1霉翔、作者開(kāi)發(fā)了Tres（腫瘤恢復(fù)T細(xì)胞）局蚀，這是一種計(jì)算模型，利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來(lái)識(shí)別對(duì)免疫抑制信號(hào)具有恢復(fù)性的T細(xì)胞的特征驴剔；Tres利用患者治療前腫瘤的大量T細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，可靠地預(yù)測(cè)黑色素瘤、肺癌、三陰性乳腺癌和B細(xì)胞惡性腫瘤免疫治療的臨床反應(yīng)狠持；

2、作者指出Tres?平臺(tái)利用了大數(shù)據(jù)建模為癌癥免疫治療瞻润，特別是T細(xì)胞療法提供了一個(gè)重要的研發(fā)工具喘垂，并且對(duì)指導(dǎo)細(xì)胞療法臨床決策提供了一個(gè)重要的依據(jù)。

美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院Peng Jiang博士課題組在國(guó)際知名期刊Nat Med在線發(fā)表題為“A T cell resilience model associated with response to immunotherapy in multiple tumor types”的論文绍撞。盡管癌癥免疫治療取得了突破性進(jìn)展正勒，但由于免疫抑制環(huán)境，大多數(shù)腫瘤反應(yīng)性T細(xì)胞無(wú)法在實(shí)體瘤中持續(xù)存在傻铣。作者開(kāi)發(fā)了Tres（腫瘤恢復(fù)性T細(xì)胞）章贞，這是一種計(jì)算模型，利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來(lái)識(shí)別對(duì)免疫抑制信號(hào)具有恢復(fù)性的T細(xì)胞的特征非洲，如轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β1鸭限、腫瘤壞死因子相關(guān)凋亡誘導(dǎo)配體和前列腺素E2。Tres利用患者治療前腫瘤的大量T細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)两踏，可靠地預(yù)測(cè)黑色素瘤败京、肺癌、三陰性乳腺癌和B細(xì)胞惡性腫瘤免疫治療的臨床反應(yīng)梦染。此外赡麦，Tres確定FIBP是許多實(shí)體瘤類型中抗腫瘤T細(xì)胞的陰性標(biāo)記物，其功能在很大程度上未知帕识。小鼠和人類供體CD8+T細(xì)胞中的FIBP基因敲除顯著增強(qiáng)了T細(xì)胞介導(dǎo)的癌癥殺傷作用泛粹。此外，小鼠T細(xì)胞中的FIBP敲除增強(qiáng)了B16腫瘤模型中過(guò)繼細(xì)胞轉(zhuǎn)移的體內(nèi)療效肮疗。FIBP基因敲除T細(xì)胞表現(xiàn)出膽固醇代謝降低晶姊，從而抑制效應(yīng)T細(xì)胞功能。這些結(jié)果表明Tres在識(shí)別T細(xì)胞有效性的生物標(biāo)記物和實(shí)體瘤免疫治療的潛在治療靶點(diǎn)方面的效用族吻。

Tres使用兩個(gè)階段來(lái)識(shí)別CD8+T細(xì)胞的基因標(biāo)記帽借，這些細(xì)胞對(duì)實(shí)體瘤中的免疫抑制信號(hào)具有恢復(fù)性（圖1a）。Tres模型首先將單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集中施加在CD8+T細(xì)胞上的免疫抑制水平量化為免疫抑制細(xì)胞因子的信號(hào)活動(dòng)（圖1a）超歌。這一計(jì)算的基礎(chǔ)可以通過(guò)黑色素瘤腫瘤的例子來(lái)說(shuō)明砍艾，其中CD8+T細(xì)胞中的轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子（TGF）-β1信號(hào)活動(dòng)與T細(xì)胞增殖水平呈負(fù)相關(guān)，這是通過(guò)細(xì)胞周期和DNA復(fù)制基因的表達(dá)推斷出來(lái)的（圖1b）巍举。從19種癌癥類型的36個(gè)單細(xì)胞RNA測(cè)序（RNA seq）數(shù)據(jù)集中確定了168個(gè)腫瘤中TGF-β1信號(hào)活性與T細(xì)胞增殖之間的一致性負(fù)相關(guān)脆荷。在對(duì)每個(gè)T細(xì)胞進(jìn)行免疫抑制定量后，第二個(gè)Tres階段利用可變相互作用試驗(yàn)來(lái)確定對(duì)實(shí)體瘤中先前確定的抑制信號(hào)（TGF-β1懊悯、TRAIL或PGE2）具有恢復(fù)性的T細(xì)胞的基因表達(dá)標(biāo)記（圖1a）蜓谋。Tres模型尋找其表達(dá)狀態(tài)減輕免疫抑制和T細(xì)胞跨T細(xì)胞增殖之間負(fù)相關(guān)的基因。例如炭分，作者發(fā)現(xiàn)免疫抑制和T細(xì)胞增殖之間的負(fù)相關(guān)性僅在IL7R低或FIBP高表達(dá)水平的T細(xì)胞中明顯（圖1c）桃焕。為了評(píng)估Tres模型，作者收集了來(lái)自19種癌癥類型的168個(gè)腫瘤的36個(gè)單細(xì)胞RNA序列數(shù)據(jù)集捧毛，其中每個(gè)腫瘤由至少100個(gè)單T細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組組成观堂。每個(gè)腫瘤都有一個(gè)Tres信號(hào)，由每個(gè)基因的一個(gè)Tres評(píng)分組成呀忧。例如师痕，前面提到的IL7R和FIBP基因在腫瘤中分別具有一致的陽(yáng)性和陰性Tres評(píng)分（圖1d）。此外而账，免疫檢查點(diǎn)基因的Tres評(píng)分為陰性胰坟，而T細(xì)胞持久性或激活標(biāo)記物的Tres評(píng)分在腫瘤中為陽(yáng)性。相比之下泞辐，免疫抑制信號(hào)受體的Tres評(píng)分并不顯著笔横，這表明受體的單細(xì)胞表達(dá)可能不是細(xì)胞因子活性的指標(biāo)。為了驗(yàn)證Tres模型的生物學(xué)相關(guān)性铛碑，作者評(píng)估了Tres特征是否可以預(yù)測(cè)先前定義的T細(xì)胞持久性標(biāo)記狠裹。最近一項(xiàng)過(guò)繼轉(zhuǎn)移TIL的研究根據(jù)與癌癥完全消退和腫瘤中TIL持續(xù)性相關(guān)的干細(xì)胞樣CD8+T細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組學(xué)特征確定了一個(gè)T細(xì)胞持續(xù)性基因特征。Tres基因得分捕獲了T細(xì)胞持久性特征的標(biāo)記（圖1e汽烦，f）涛菠。

為了驗(yàn)證Tres模型的臨床相關(guān)性，作者評(píng)估了Tres信號(hào)在預(yù)測(cè)T細(xì)胞在癌癥免疫治療中的有效性方面的作用撇吞。使用從公共存儲(chǔ)庫(kù)收集的免疫治療原始單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)集訓(xùn)練了一個(gè)Tres信號(hào)俗冻，并在所有進(jìn)一步分析中使用了這個(gè)Tres信號(hào)，并創(chuàng)建了每個(gè)患者所有單T細(xì)胞數(shù)據(jù)的平均體T細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)圖譜牍颈。盡管Tres信號(hào)訓(xùn)練不涉及任何免疫治療信息迄薄，但與ICI應(yīng)答者治療前腫瘤（圖2a）和治療后腫瘤的T細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)特征相比，中位數(shù)Tres信號(hào)與ICI應(yīng)答者的T細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)特征具有更好的相關(guān)性煮岁。與許多已發(fā)表的T細(xì)胞抗腫瘤療效特征相比讥蔽，Tres特征的表現(xiàn)通常是最好的（圖2b）涣易。平均而言，Tres是最具預(yù)測(cè)性的特征碼（圖2c）冶伞。由于成本高且對(duì)高質(zhì)量樣本的要求新症，單細(xì)胞分析在臨床實(shí)踐中仍然不常見(jiàn)。因此响禽，在對(duì)黑色素瘤進(jìn)行過(guò)繼性細(xì)胞治療之前徒爹，利用腫瘤體積圖評(píng)估T細(xì)胞擴(kuò)增的中位Tres信號(hào)。在具有高細(xì)胞毒性T細(xì)胞浸潤(rùn)的腫瘤特征中芋类，Tres特征和腫瘤整體表達(dá)特征之間的相關(guān)性可以可靠地預(yù)測(cè)生存結(jié)果（圖2d）隆嗅。然而，如果大量腫瘤中的T細(xì)胞浸潤(rùn)水平較低侯繁，Tres信號(hào)將無(wú)法預(yù)測(cè)胖喳。類似地，當(dāng)腫瘤內(nèi)T細(xì)胞浸潤(rùn)較高時(shí)巫击，Tres使用大量腫瘤轉(zhuǎn)錄組以最高的準(zhǔn)確性預(yù)測(cè)ICI結(jié)果禀晓，盡管這種準(zhǔn)確性對(duì)于特定隊(duì)列可能并不顯著。這些結(jié)果是可以預(yù)期的坝锰，因?yàn)門res特征碼訓(xùn)練只使用T細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組粹懒，在T細(xì)胞浸潤(rùn)較低的腫瘤中不富集，即使在T細(xì)胞炎癥的腫瘤中也可能受到非淋巴細(xì)胞群的干擾顷级。此外凫乖，Tres信號(hào)不能使用免疫抑制信號(hào)低表達(dá)腫瘤的大量表達(dá)數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)ICI結(jié)果。這些腫瘤細(xì)胞內(nèi)治療的免疫特異性共同表明腫瘤細(xì)胞內(nèi)治療的結(jié)果弓颈。雖然Tres模型是用來(lái)分析實(shí)體瘤的帽芽，但Tres信號(hào)的中值可以預(yù)測(cè)造血系統(tǒng)惡性腫瘤中的抗CD19 CAR-T反應(yīng)。分析了CD19 CAR-T療效的臨床研究翔冀，通過(guò)慢性淋巴細(xì)胞白血病的患者反應(yīng)或急性淋巴細(xì)胞白血病的B細(xì)胞再生障礙持續(xù)時(shí)間來(lái)衡量导街。這些結(jié)果表明，Tres可用于在免疫治療開(kāi)始前篩查患者纤子。

在所有人類基因中搬瑰，F(xiàn)IBP作為T細(xì)胞有效性的標(biāo)記物之一（圖3a）。關(guān)于FIBP的文獻(xiàn)很少控硼，除了FIBP可能與FGF1結(jié)合泽论，以及FIBP增強(qiáng)結(jié)直腸癌細(xì)胞系的化療耐藥性。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)集中卡乾，F(xiàn)IBP的Tres得分始終為負(fù)值（圖1d）翼悴。在實(shí)體瘤中，抗PD-1應(yīng)答者的T細(xì)胞中的纖維蛋白表達(dá)水平顯著低于無(wú)應(yīng)答者（圖3a幔妨，b）鹦赎。圖3c腫瘤轉(zhuǎn)移前FIBP高水平的過(guò)繼性TIL表達(dá)表明腫瘤轉(zhuǎn)移后的總體存活率更差谍椅。此外，大量腫瘤轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的高FIBP表達(dá)與T細(xì)胞功能障礙相關(guān)（圖3d）古话。上述分析旨在揭示T細(xì)胞抗腫瘤療效的標(biāo)記基因毯辅。基因標(biāo)記反映了相關(guān)性煞额，這種相關(guān)性可能來(lái)自間接影響，而不是因果關(guān)系沾谜。建立調(diào)節(jié)因果關(guān)系的機(jī)制對(duì)于治療應(yīng)用的發(fā)展是可取的膊毁。因此，試圖描述Tres標(biāo)記基因敲除（KOs）在調(diào)節(jié)T細(xì)胞殺傷腫瘤中的作用基跑。

進(jìn)一步研究了人類和小鼠系統(tǒng)中的FIBP-KO表型（圖4a）婚温。對(duì)于人類，使用NY-ESO-1+黑色素瘤細(xì)胞（A375和Mel624）作為NY-ESO-1 TCR T細(xì)胞的靶細(xì)胞媳否。對(duì)于小鼠栅螟，使用gp100+B16-mhgp100細(xì)胞系和相應(yīng)的Pmel-1 TCR T細(xì)胞。目標(biāo)基因是FIBP篱竭，CBLB作為陽(yáng)性對(duì)照力图，AAVS1（人類）或Rosa26（小鼠）作為CRISPR-KOs的陰性對(duì)照（圖4b）。利用孵育細(xì)胞成像系統(tǒng)評(píng)估T細(xì)胞與腫瘤細(xì)胞共同培養(yǎng)的抗癌效果（圖4c）掺逼。含有對(duì)照KO的T細(xì)胞具有與人類和小鼠供體的親代T細(xì)胞相似的抗癌功效吃媒。相比之下，F(xiàn)IBP敲除的人類和小鼠T細(xì)胞殺死癌細(xì)胞的效率高于對(duì)照KOs（圖4c-e）吕喘。此外赘那，F(xiàn)IBP-KOs可增強(qiáng)人和小鼠原代T細(xì)胞中T細(xì)胞效應(yīng)因子的釋放，包括IFN-γ和TNF（圖4f）氯质∧贾郏總的來(lái)說(shuō)，F(xiàn)IBP-KO的效應(yīng)與陽(yáng)性對(duì)照CBLB-KO相似（圖4d-f）闻察。

接下來(lái)拱礁，評(píng)估了敲除FIBP是否可以提高轉(zhuǎn)移的Pmel-1 T細(xì)胞的體內(nèi)療效（圖5a）。將C57BL/6小鼠隨機(jī)分為五個(gè)不同的治療組：Fibp-KO（n=15）蜓陌、Rosa-KO（陰性對(duì)照觅彰，n=15）、Cblb-KO（陽(yáng)性對(duì)照钮热，n=15）填抬、野生型T細(xì)胞（n=5）和無(wú)治療對(duì)照（生理鹽水注射，n=5）隧期。與未經(jīng)治療的對(duì)照組相比飒责，野生型T細(xì)胞過(guò)繼轉(zhuǎn)移顯著抑制腫瘤的生長(zhǎng)赘娄，并且Rosa-KO T細(xì)胞的抗腫瘤效果并不低于親代T細(xì)胞。與Rosa26 KO T細(xì)胞相比宏蛉，F(xiàn)ibp KO T細(xì)胞顯著縮小了腫瘤大星簿省（圖5b-d）。圖5c-1b細(xì)胞的總體積縮小效果與對(duì)照組小鼠相當(dāng)拾并。Fibp和Cblb KO T細(xì)胞受體的存活時(shí)間明顯長(zhǎng)于Rosa26 KO T細(xì)胞受體（圖5e）揍堰。這些結(jié)果支持Fibp-KO作為增強(qiáng)過(guò)繼性T細(xì)胞治療的潛在治療方法。為了分析T細(xì)胞的體內(nèi)表型嗅义，在過(guò)繼細(xì)胞轉(zhuǎn)移后的早期時(shí)間點(diǎn)對(duì)從小鼠腫瘤中分離的CD8+T細(xì)胞進(jìn)行了分析屏歹。Fibp KO T細(xì)胞的CD69+比例高于Rosa26 KO T細(xì)胞（圖5f）。類似地之碗，在之前的體外分析中蝙眶，人類和小鼠供體FIBP-KO T細(xì)胞的CD69+分?jǐn)?shù)均高于對(duì)照組的KO T細(xì)胞。高比例的CD69+T細(xì)胞表明Fibp-KO后T細(xì)胞的活化增加褪那。同時(shí)幽纷，數(shù)據(jù)表明FIBP不會(huì)影響記憶或效應(yīng)T細(xì)胞分化，但作者不認(rèn)為T細(xì)胞的抗腫瘤效果必然與這些細(xì)胞狀態(tài)有關(guān)博敬。

為了深入了解FIBP對(duì)T細(xì)胞的抑制作用友浸，在小鼠Pmel-1 FIBP-KO和Rosa26 KO T細(xì)胞中進(jìn)行了RNA seq檢測(cè)（圖6a）。IPA顯示偏窝，F(xiàn)ibp-KO的所有富集與膽固醇代謝的下調(diào)有關(guān)（圖6b）尾菇。與Rosa26 KOs相比，F(xiàn)ibp KOs可下調(diào)多種膽固醇生物合成酶的表達(dá)囚枪，如Hmgcs和Sqle以及細(xì)胞表面受體Ldlr派诬，從而調(diào)節(jié)膽固醇攝入，并上調(diào)膽固醇外排基因Abca1的表達(dá)（圖6c）链沼。使用逆轉(zhuǎn)錄定量PCR（RT–qPCR）在小鼠和人類FIBP-KO T細(xì)胞上驗(yàn)證了幾種已鑒定的膽固醇途徑基因（ABCA1默赂、LDLR和SREBF2）和膽固醇合成酶的表達(dá)改變（圖6d）。還通過(guò)Fibp-KO細(xì)胞證實(shí)LDLR蛋白和SREBF2蛋白的表達(dá)降低（圖6e）括勺。相反缆八，F(xiàn)ibp在T細(xì)胞中的過(guò)度表達(dá)導(dǎo)致膽固醇代謝調(diào)節(jié)因子在mRNA和蛋白質(zhì)水平的表達(dá)增加（圖6f）。與這些結(jié)果一致疾捍，F(xiàn)ibp-KO T細(xì)胞的體內(nèi)和體外膽固醇水平均顯著低于Rosa26-KO T細(xì)胞的水平（圖6g）奈辰。此外，F(xiàn)ibp過(guò)度表達(dá)后乱豆，T細(xì)胞中的膽固醇水平顯著增加（圖6h）奖恰。之前的研究表明，CBLB抑制通過(guò)促進(jìn)IL-2的產(chǎn)生和自分泌信號(hào)，增強(qiáng)T細(xì)胞的抗腫瘤效果瑟啃。然而论泛，F(xiàn)IBP-KO不會(huì)改變T細(xì)胞中IL-2的產(chǎn)生。這些數(shù)據(jù)表明蛹屿，抑制不同的基因靶點(diǎn)可能通過(guò)正交機(jī)制促進(jìn)T細(xì)胞的抗腫瘤效果屁奏。之前的研究已經(jīng)揭示了膽固醇通過(guò)抑制效應(yīng)T細(xì)胞功能和誘導(dǎo)T細(xì)胞衰竭對(duì)T細(xì)胞抗腫瘤活性的影響。同樣错负，共培養(yǎng)試驗(yàn)表明坟瓢，膽固醇治療T細(xì)胞可顯著抑制癌癥殺傷效果（圖6i）。然而犹撒，即使在膽固醇治療后载绿，F(xiàn)ibp KO T細(xì)胞仍能保持其抗癌功效（圖6i）。

作者開(kāi)發(fā)了一個(gè)Tres模型油航，用于識(shí)別實(shí)體瘤中對(duì)免疫抑制信號(hào)有抵抗力的T細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組特征。Tres信號(hào)可以可靠地預(yù)測(cè)T細(xì)胞在免疫檢查點(diǎn)阻斷和過(guò)繼細(xì)胞治療（ACT）中的療效怀浆，使用來(lái)自腫瘤的訓(xùn)練數(shù)據(jù)谊囚，而無(wú)需任何伴隨的免疫治療。這一優(yōu)勢(shì)非常重要执赡，因?yàn)榇蠖鄶?shù)單細(xì)胞研究沒(méi)有免疫治療結(jié)果信息镰踏。Tres可以重新利用來(lái)自不同癌癥類型的單細(xì)胞數(shù)據(jù)來(lái)開(kāi)發(fā)治療前生物標(biāo)記物。應(yīng)注意Tres的一些局限性沙合。在訓(xùn)練Tres評(píng)分時(shí)奠伪，168個(gè)腫瘤中有38個(gè)沒(méi)有達(dá)到統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。潛在的原因包括數(shù)據(jù)質(zhì)量不足首懈、腫瘤中缺乏抗腫瘤T細(xì)胞或Tres未模擬的替代性免疫抑制信號(hào)绊率。因此，在高度免疫抑制的腫瘤中究履，Tres模型不會(huì)給出有意義的結(jié)果滤否，在這些腫瘤中，所有T細(xì)胞都嚴(yán)重功能障礙最仑，沒(méi)有任何變異藐俺。分析顯示FIBP是實(shí)體瘤中抗腫瘤T細(xì)胞的陰性標(biāo)記物，其機(jī)制研究表明FIBP KO通過(guò)降低膽固醇代謝增強(qiáng)T細(xì)胞的抗腫瘤效果泥彤。之前的研究以及作者的研究結(jié)果表明欲芹，免疫療法與抗膽固醇療法相結(jié)合是有希望的。此外吟吝，F(xiàn)IBP-KO可以減少但不能完全消除T細(xì)胞中膽固醇的生物合成菱父。據(jù)報(bào)道，F(xiàn)IBP是一種與酸性成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子結(jié)合的細(xì)胞內(nèi)蛋白，是一種致癌基因滞伟，可誘導(dǎo)結(jié)直腸癌細(xì)胞產(chǎn)生化療耐藥性揭鳞。FIBP基因敲除對(duì)癌細(xì)胞的生長(zhǎng)抑制作用，與FIBP-KO對(duì)CD8+T細(xì)胞的療效促進(jìn)作用相反梆奈，表明FIBP可能以譜系依賴的方式調(diào)節(jié)不同的細(xì)胞程序野崇。此外，這些結(jié)果共同表明FIBP抑制劑可能在癌癥和T細(xì)胞中發(fā)揮抗腫瘤作用亩钟。雖然過(guò)繼性T細(xì)胞轉(zhuǎn)移中的FIBP-KO是可行的乓梨，但尚不清楚是否有可能設(shè)計(jì)FIBP的藥理抑制劑。此外清酥，研究沒(méi)有評(píng)估FIBP-KO T細(xì)胞是否能與ICIs和其他治療（如靶向治療扶镀、化療或放療）協(xié)同作用。因此焰轻，需要更多的數(shù)據(jù)來(lái)支持FIBP作為治療靶點(diǎn)的可行性臭觉。作者預(yù)計(jì)，基礎(chǔ)研究人員將使用Tres來(lái)確定T細(xì)胞中的新靶點(diǎn)辱志，以尋求下一代細(xì)胞療法蝠筑，臨床研究人員將使用Tres來(lái)確定免疫治療反應(yīng)生物標(biāo)記物，以供常規(guī)臨床使用揩懒，臨床醫(yī)生將直接使用Tres來(lái)預(yù)測(cè)預(yù)制樣品或輸液產(chǎn)品的細(xì)胞治療反應(yīng)什乙。

教授介紹

Peng Jiang博士于2019年7月在國(guó)家癌癥研究所（NCI）開(kāi)始了他的研究項(xiàng)目。在博士后研究期間已球，他開(kāi)發(fā)了重新利用公共領(lǐng)域數(shù)據(jù)的計(jì)算框架臣镣，以識(shí)別癌癥免疫治療耐藥性的生物標(biāo)記物和調(diào)節(jié)器。值得注意的是智亮，他的計(jì)算模型揭示了癌細(xì)胞可以利用細(xì)胞毒性淋巴細(xì)胞的自我保護(hù)策略來(lái)抵抗免疫檢查點(diǎn)阻斷下的淋巴細(xì)胞殺傷忆某。他的研究重點(diǎn)是開(kāi)發(fā)綜合框架，利用公共領(lǐng)域的大數(shù)據(jù)資源來(lái)確定癌癥治療耐藥性的監(jiān)管阔蛉。癌癥研究面臨的一個(gè)普遍挑戰(zhàn)是缺乏了解每種治療方法臨床療效的數(shù)據(jù)褒繁，而具有不同作用機(jī)制的新藥每年都會(huì)獲得批準(zhǔn)。為了填補(bǔ)這一空白馍忽，他正在開(kāi)發(fā)統(tǒng)計(jì)和機(jī)器學(xué)習(xí)基礎(chǔ)設(shè)施棒坏，將大量以前的數(shù)據(jù)隊(duì)列中的知識(shí)轉(zhuǎn)移到新癌癥生物學(xué)問(wèn)題的研究中。專業(yè)領(lǐng)域包括：1）大數(shù)據(jù)集成遭笋，2）癌癥基因組學(xué)坝冕，3）機(jī)器學(xué)習(xí)，4）生物統(tǒng)計(jì)學(xué)瓦呼，5）精確醫(yī)學(xué)喂窟，6）癌癥免疫治療测暗。

參考文獻(xiàn)

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