【項(xiàng)目文章攻泼,IF=17.65】CyTOF解碼人類胸腺上皮腫瘤

人類胸腺上皮腫瘤(TET)是前縱隔常見的惡性腫瘤,生物學(xué)認(rèn)識(shí)有限诡延。

浙江大學(xué)伍品及柴瑩教授團(tuán)隊(duì)通過?CyTOF滞欠、scRNA-seq?等技術(shù)全面描述了 TETs 的免疫圖譜腫瘤內(nèi) T 細(xì)胞的發(fā)育模式可識(shí)別出三種類型肆良,TETs 中上皮腫瘤細(xì)胞的分子亞型決定了它們的腫瘤免疫微環(huán)境筛璧,在區(qū)分上皮性腫瘤細(xì)胞類型的背景下描述了腫瘤浸潤(rùn)性 T 細(xì)胞的發(fā)育變化和 TCR 庫。研究成果“The immune landscape of human thymic epithelial tumors”發(fā)表在期刊《Nature Communications》惹恃。

其中夭谤,CyTOF 檢測(cè)及分析由普羅亭提供。

樣本分組及研究方法

樣本分組:TET n=22巫糙;Normal thymus(N)n=3

圖1??樣本分組

研究方法:CyTOF朗儒、scRNA-seq、TCR 圖譜、組織學(xué)分析醉锄、FCM 檢測(cè)和免疫熒光檢測(cè)

圖2? 研究思路

Highlights

首次建立人胸腺上皮腫瘤全景圖譜

首次提出人胸腺上皮腫瘤的免疫分型體系

首次明確了胸腺上皮腫瘤的起源與免疫微環(huán)境形成的關(guān)系乏悄,并初步提出了相應(yīng)的人胸腺上皮腫瘤分子分型策略

主要研究結(jié)果

人胸腺上皮腫瘤免疫圖譜的異質(zhì)性

研究人員首先使用?CyTOF?建立了一個(gè) 40 多個(gè)標(biāo)記組成的 panel 檢測(cè)Normal thymus 和 TETs 的細(xì)胞組成。通過細(xì)胞注釋恳不,發(fā)現(xiàn) CD45+免疫細(xì)胞檩小,而不是 EpCAM+ 腫瘤細(xì)胞,構(gòu)成了 TET 的主要細(xì)胞亞群烟勋,并基于腫瘤微環(huán)境內(nèi)免疫細(xì)胞構(gòu)成的異質(zhì)性提出了一個(gè)由淋巴細(xì)胞構(gòu)成指導(dǎo)的胸腺上皮腫瘤的一個(gè)免疫分型體系(1规求、2、3型)卵惦。CD3-CD4+CD8+ 細(xì)胞的比例在 1 型最高阻肿,在 3 型中最低。從1型到3型鸵荠,CD3-CD4+CD8+ 細(xì)胞的豐度有明顯下降的趨勢(shì)冕茅。B 細(xì)胞、DC 細(xì)胞蛹找、粒細(xì)胞和 NK 細(xì)胞在腫瘤中的比例在 1 型最低姨伤,在 3 型中最高,并有從 1 型到 3 型的豐度逐漸增加的趨勢(shì)庸疾。3 型中單核細(xì)胞豐富乍楚。與 WHO 分類和 Masaoka 分期相比,研究人員提出的免疫分型體系更關(guān)注腫瘤中免疫細(xì)胞亞群的差異届慈。

圖3??人類胸腺和 TET?的細(xì)胞組成

不同TET中存在不同的T細(xì)胞發(fā)育模式

進(jìn)一步研究 TET 中 T 細(xì)胞發(fā)育的變化徒溪,發(fā)現(xiàn)未成熟的 DP(CD4+CD8+)細(xì)胞在 1 型 TET 中占優(yōu)勢(shì),而成熟的 SP(CD4+ or CD8+)細(xì)胞在 2 型和 3 型腫瘤中占優(yōu)勢(shì)金顿,DN(CD4-CD8-)和 DP 細(xì)胞的比例在 1 型中最高臊泌,在 3 型中最低。從 1 型到 3 型 TET DP 細(xì)胞顯示出下降的趨勢(shì)揍拆,但腫瘤中 CD4+ 和 CD8+ T 細(xì)胞的比例顯示出從 1 型到 3 型 TET 的增加趨勢(shì)渠概,這與 DN 和 DP 細(xì)胞觀察到的模式相反。此外嫂拴,免疫熒光染色顯示DP和SP細(xì)胞分別位于2型TET的皮質(zhì)和髓質(zhì)樣結(jié)構(gòu)中播揪,而在1型和3型TET中未觀察到典型的皮質(zhì)和髓質(zhì)樣結(jié)構(gòu)。

圖4??胸腺和?TET?亞型中的?T 細(xì)胞亞群

該研究證明了以髓胸腺上皮細(xì)胞(mTEC)表型為特征并以 KRT14/GNB3 表達(dá)為標(biāo)志的腫瘤細(xì)胞亞群在 1 型 TET 中積累筒狠,而 T 細(xì)胞陽性選擇受到抑制猪狈。2 型 TET 以CCL25+ 為主,似乎促進(jìn)T細(xì)胞陽性選擇的 cTEC 樣細(xì)胞辩恼。作為 3 型 TET 特征的CHI3L1+ mTEC 樣細(xì)胞似乎不支持 T 細(xì)胞發(fā)育雇庙,然而谓形,它們可能會(huì)誘導(dǎo)組織駐留的 CD8+ T 細(xì)胞反應(yīng)∽垂玻總之套耕,研究工作表明 TET 中上皮腫瘤細(xì)胞的分子亞型決定了它們的腫瘤免疫微環(huán)境,因此GNB3?CHI3L1?可能預(yù)測(cè)這些腫瘤的免疫行為和預(yù)后峡继。

圖5??三種類型的?TET?的發(fā)育模式及不同類型的細(xì)胞之間的相互作用

【參考文獻(xiàn)】Xin Z, Lin M, Hao Z, Chen D, Chen Y, Chen X, Xu X, Li J, Wu D, Chai Y, Wu P. The immune landscape of human thymic epithelial tumors. Nat Commun. 2022 Sep 17;13(1):5463.?

【原文鏈接】https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36115836/

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