前言
骨肉瘤是最常見的原發(fā)性骨實性惡性腫瘤之一环戈,好發(fā)于青少年和年輕人∨炀模患者的標(biāo)準(zhǔn)治療包括化療和手術(shù)院塞。隨著各種先進治療方法的發(fā)展,患者的存活率大大提高了性昭。然而拦止,目前還沒有已知的預(yù)防方法。因此糜颠,深入了解其發(fā)生機制创泄,開發(fā)新的骨肉瘤治療藥物迫在眉睫艺玲。
N6-methyladenosine (m6A) 是真核生物mRNA中最豐富的可逆甲基化修飾括蝠。近年來鞠抑,許多研究集中在m6a修飾的mRNA的生物學(xué)功能上。m6A修飾被發(fā)現(xiàn)參與多種生物學(xué)過程忌警,并在癌癥進展中發(fā)揮重要作用搁拙。如,F(xiàn)TO在急性髓系白血病(AML)中起著致癌因子的作用法绵。ALKBH5已被證明與胰腺癌箕速、膠質(zhì)母細胞瘤有關(guān),并影響雄性小鼠的生育能力朋譬。然而盐茎,對于m6A修飾在人骨肉瘤中的功能和潛在機制仍有很大程度的未知。
研究結(jié)果
1. m6A去甲基化酶ALKBH5在人骨肉瘤中下調(diào)
作者首先采用m6A ELISA和免疫熒光(IF)法定量人骨肉瘤細胞系U2OS徙赢、Saos2字柠、143B和人成骨細胞(hOB) hFOB1.19細胞系中m6A的含量。結(jié)果顯示狡赐,骨肉瘤細胞中m6A含量顯著升高窑业。此外,與hOB細胞相比枕屉,所有三種骨肉瘤細胞系中去甲基化酶ALKBH5 mRNA與m6A含量呈負相關(guān)顯著降低常柄,但在METTL3、METTL14搀擂、WTAP和FTO中無此現(xiàn)象西潘。同時,免疫染色證實哨颂,與hOB細胞相比喷市,U2OS、Saos2咆蒿、143B骨肉瘤細胞系中的ALKBH5顯著降低东抹。此外,在人骨肉瘤組織中檢測到ALKBH5的蛋白表達低于正常骨組織沃测。我們進一步應(yīng)用免疫組化(IHC)檢測含102個組織芯的骨肉瘤組織微陣列(TMAs)中ALKBH5蛋白的表達缭黔。與正常骨組織相比,在惡性骨肉瘤核心部位蒂破,特別是IVB期(最高程度的骨肉瘤)檢測到ALKBH5蛋白表達顯著降低馏谨。來自TCGA數(shù)據(jù)集的Kaplan-Meier生存分析顯示ALKBH5高表達的患者存活率較高,而低ALKBH5表達的患者存活率較低附迷。以上結(jié)果表明惧互,在人骨肉瘤中ALKBH5普遍下調(diào)哎媚,可能介導(dǎo)m6A修飾,在人骨肉瘤中發(fā)揮重要作用喊儡。
2. ALKBH5-依賴的 m6A去甲基化嚴(yán)重影響骨肉瘤細胞的生長和運動
為了確定ALKBH5調(diào)控m6A修飾是否在骨肉瘤細胞中起作用拨与,作者分別過表達、敲降A(chǔ)LKBH5的表達來驗證其細胞功能艾猜。我們檢測了ALKBH5對細胞增殖买喧、遷移和侵襲的影響。與預(yù)期一致匆赃,過表達ALKBH5顯著抑制U2OS細胞的增殖淤毛、侵襲和遷移能力,而抑制ALKBH5的表達則誘導(dǎo)相反的作用算柳。此外低淡,當(dāng)ALKBH5過表達時,早期和晚期凋亡細胞百分比均顯著增加瞬项,而ALKBH5敲低對細胞的凋亡影響甚微蔗蹋。細胞克隆實驗也產(chǎn)生類似的結(jié)果。
3. 鑒定ALKBH5 / m6a - pre - miR - 181 - b - 1 / miR -181b-5p-YAP軸作為一種新的通路抑制骨肉瘤腫瘤的進展
(1)ALKBH5通過調(diào)控pre-miR-181b-1的表達水平抑制骨肉瘤細胞增殖
如上所示滥壕,作者已經(jīng)證明了ALKBH5依賴的m6A rna去甲基化對骨肉瘤腫瘤抑制的重要性纸颜。接下來,進一步深入了解其具體的分子機制绎橘。MiRNA的加工過程也受到骨肉瘤的特異性調(diào)控胁孙。然而,尚無報道顯示m6A修飾在骨肉瘤miRNA加工過程中的生物學(xué)功能称鳞。因此涮较,作者使用m6A 芯片在對照和過表達ALKBH5的U2OS細胞中鑒定ALKBH5修飾的miRNAs前體。通過微陣列檢測到773個pre- miRNA冈止,鑒定出11個在ALKBH5過表達的細胞中狂票,比對照細胞減少20%(>減少1.2倍)的pre- miRNA。值得注意的是熙暴,在pre- mirna中闺属,pre-miR-181b-1再過表達ALKBH5后,甲基化顯著降低周霉。更重要的是掂器,pre-miR-181b-1序列在不同物種間廣泛保守。這些發(fā)現(xiàn)表明在骨肉瘤中pre-miR-181b-1是ALKBH5的一個潛在的作用靶點俱箱。進一步發(fā)現(xiàn)国瓮,premiR-181b-1在m6A-RIP中富集,而在IgG-IP中不富集。此外乃摹,pre-miR-181b-1和成熟miR-181b-5p在骨肉瘤細胞中明顯低于hOB細胞禁漓。過表達ALKBH5可顯著增加U2OS細胞中premiR-181b-1和miR-181b-5p的表達水平。相反孵睬,抑制ALKBH5產(chǎn)生相反的效果播歼。正如作者所猜想,miR-181b-5p導(dǎo)致細胞遷移和細胞增殖的減少肪康。miR-181b-5p下調(diào)(AMO-181b-5p)部分挽救了U2OS細胞中ALKBH5過表達導(dǎo)致的細胞遷移和增殖下降荚恶。
(2)YAP是人骨肉瘤細胞中miR-181-5p的關(guān)鍵靶基因
然后通過計算預(yù)測尋找miR-181-5p候選靶基因。通過這種方式磷支,作者發(fā)現(xiàn)Yesassociated protein 1 (YAP)是miR-181-5p潛在的靶基因。有報道稱YAP是一種致癌基因食寡,在多種腫瘤發(fā)生發(fā)展中具有重要作用雾狈。接下來,作者證實了過表達的miR-181b-5p確實直接抑制了其靶基因YAP在骨肉瘤細胞中的表達抵皱,且發(fā)現(xiàn)過表達ALKBH5明顯抑制了U2OS細胞中YAP的mRNA和蛋白水平善榛,而抑制ALKBH5則使YAP的表達升高。同時呻畸,作者證實了YAP對骨肉瘤細胞生長的影響移盆。siRNA沉默YAP顯著抑制了U2OS細胞的增殖、侵襲伤为、遷移和集落形成能力咒循。
(3)YAP消除了ALKBH5對骨肉瘤細胞活力和小鼠異種腫瘤生長的抑制作用
為探究ALKBH5與YAP的相互關(guān)系,作者進一步分析了細胞生長的影響绞愚。與單獨過表達ALKBH5相比叙甸,ALKBH5與YAP共表達組的細胞增殖明顯增加。YAP還抵消了ALKBH5對U2OS細胞侵襲和遷移的抑制作用位衩,YAP顯著提高了活細胞百分率裆蒸,減少了凋亡細胞,恢復(fù)了集落形成能力糖驴。并且僚祷,作者利用異種骨肉瘤小鼠模型評估了ALKBH5介導(dǎo)的m6A去甲基化的體內(nèi)有效性。腫瘤體積和重量的降低贮缕,證明了ALKBH5過表達降低了骨肉瘤腫瘤的生長辙谜,而這一效果通過共轉(zhuǎn)染過表達的YAP而抵消。
4)m6A讀取蛋白YTHDF2正調(diào)節(jié)pre-miR-181b-1的穩(wěn)定
因為ALKBH5介導(dǎo)的m6A去甲基化似乎增加了pre-miR-181b-1的表達跷睦,猜想pre-miR-181b-1是YTHDF2(促進m6A甲基化RNA降解的m6A讀取蛋白)的一個靶點筷弦,與作者的猜想一致,再YTHDF2-IP組分中觀察到pre-miR-181b-1的強烈富集。進一步烂琴,在U2OS細胞使用siYTHDF2敲降其表達后爹殊,pre-miR-181b-1和miR-181b-5p的表達均增加。此外奸绷,siYTHDF2可進一步增強ALKBH5過表達的抑瘤作用梗夸。以上數(shù)據(jù)表明ALKBH5介導(dǎo)的pre-miR-181b-1 m6A去甲基化在骨肉瘤中起關(guān)鍵作用。
4. 鑒定YAP mRNA作為ALKBH5在骨肉瘤中的直接靶點
(1)ALKBH5直接調(diào)控YAP的mRNA和蛋白穩(wěn)定性
有趣的是号醉,根據(jù)基于序列的m6A修飾位點預(yù)測網(wǎng)站(http://www.cuilab.cn/ SRAMP)反症,作者觀察到Y(jié)AP基因的mRNA攜帶9個潛在的m6A修飾位點。接下來作者驗證了ALKBH5是否可以直接調(diào)控YAP的m6A甲基化和基因降解畔派。采用基因特異性m6A-qPCR檢測YAP的表達铅碍。過表達ALKBH5后,m6A- RIP組YAP mRNA中m6A豐度明顯降低线椰,IgG-RIP組未見明顯變化胞谈。此外,與siNC組相比憨愉,siALKBH5在轉(zhuǎn)錄抑制劑actinomycin D (ActD)存在的情況下增強了U2OS細胞中YAP mRNA的穩(wěn)定性烦绳。同時,siALKBH5在翻譯抑制劑環(huán)己酰亞胺(CHX)的作用下抑制了YAP的降解配紫。然而径密,過表達ALKBH5產(chǎn)生相反的作用,導(dǎo)致骨肉瘤細胞中YAP-mRNA穩(wěn)定性顯著下降躺孝,YAP蛋白降解增加享扔。
(2)m6A-依賴的YAP的翻譯增強與YTHDF1呈正相關(guān)
以上結(jié)果表明,ALKBH5介導(dǎo)的m6A去甲基化抑制了YAP的表達括细,我們推測甲基化的YAP轉(zhuǎn)錄本是YTHDF1(促進甲基化轉(zhuǎn)錄本翻譯的m6A讀取蛋白)的潛在靶點伪很。與IgG-RIP組相比,YTHDF1組YAP mRNA中的豐度明顯增加奋单,說明YTHDF1能夠識別YAP mRNA中的m6修飾位點砚作。接下來奔誓,作者發(fā)現(xiàn)YTHDF1 siRNA (siYTHDF1)降低了YAP蛋白水平只损。且在ALKBH5過表達的U2OS細胞中反肋,過表達YTHDF1導(dǎo)致YAP增加。此外贷笛,與預(yù)期一致应又,上調(diào)YTHDF1水平可部分恢復(fù)對U2OS細胞增殖、侵襲乏苦、遷移株扛、凋亡和集落形成能力的抑制作用尤筐。
總結(jié)
總的來說,作者的結(jié)果首次表明ALKBH5是一種抗腫瘤或促凋亡因子洞就,至少部分地通過直接m6A甲基化YAP及甲基化pre-miR-181b-1間接下調(diào)YAP水平的雙機制抑制YAP的表達來發(fā)揮作用盆繁。同時,作者也證明了pre-miRNAs可以被ALKBH5甲基化調(diào)控其成熟加工的過程旬蟋。