2022-09-05 | 關(guān)于QTL，GWAS之間的關(guān)系以及其衍生概念

1.QTL:Quantitative Trait Loci每庆，概念自己查，說的是基因型和snp位點(diǎn)的關(guān)系缤灵，多用于單一種群，遺傳背景簡單的腮出，避免受population structure的影響

2.GWAS，說的也是基因型和snp位點(diǎn)的關(guān)系胚嘲，但是可以用于多種群間，比起qtl馋劈，他對于種群遺傳背景的要求相對來說簡單晾嘶。

3.QTL的衍生概念

? ?1.cis-eQTL, 也稱之為local eQTL口注，順式eQTL

? ?2.trans-eQTL, 也稱之為distant eQTL, 反式eQTL

? ??cis-eQTL是snp在基因調(diào)控區(qū)域的

? ? trans-eQTL不在基因區(qū)域君珠，一般大于20MB寝志，可能不在同一條染色體策添。



關(guān)于順式和反式調(diào)控看這個(gè)鏈接材部，說的比較清晰
(25 封私信 / 11 條消息) 如何理解順式作用元件唯竹、反式作用因子中的“順式”“反式”？ - 知乎 (zhihu.com)

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