今天可能雙11忌卤，生信微信推送很多都暫停像啼，只有一篇關于CNV變異的推送啊胶，其次今天進一步學習了先前的推送--中級繪圖
CNV變異指的是拷貝數(shù)變異，與SNP同等重要慌随，甚至可以說比SNP還要重要芬沉，不僅在人類基因組，在其他動植物基因組中也普遍存在阁猜，具體來說就是染色體上大小介于1kb~3Mb的DNA片段的變異丸逸，一個基因在染色體中的一條染色單體上數(shù)目為1，在染色體復制過程中剃袍，因為各種原因黄刚，導致在復制結束之后，子代染色體中的一條染色單體上數(shù)目由1變成2或者n（n為不等于1的自然數(shù)）民效，就發(fā)生了拷貝數(shù)目變異憔维。（如下圖）
其次涛救，學習R語言中相關圖形包的使用，主要有以下幾種：
1业扒，plot函數(shù)：主要繪制散點圖检吆，結合abline()函數(shù)來添加最佳擬合的線性直線，lowess()函數(shù)來添加一條平滑曲線程储。R有兩個平滑曲線擬合函數(shù)：lowess()和loess()蹭沛。loess是基于lowess表達式版本的更新和更強大的擬合函數(shù)。兩個函數(shù)默認值不同章鲤。
2.car包中的scatterplot()函數(shù)可以繪制散點圖并添加擬合曲線摊灭、邊界箱線圖和置信橢圓，還可以按子集繪圖和交互式識別點
3.pairs()函數(shù)可以創(chuàng)建基礎的散點圖矩陣咏窿。
4.car包中的scatterplotMatrix()函數(shù)也可以生成散點圖矩陣斟或，并且可以：以某個因子為條件繪制散點圖矩陣；包含線性和平滑擬合曲線集嵌；在主對角線放置箱線圖萝挤、密度圖或直方圖；在各單元格邊界添加軸須圖根欧。
5.gclus包中的cpairs()函數(shù)提供了一個散點圖矩陣的變種：它可以重排矩陣中的變量位置怜珍，讓相關性更高的變量更靠近主對角線，還能對個單元格進行顏色編碼來展示變量間相關性大小凤粗。
6.scatterplot3d()函數(shù)進行三維散點圖繪制酥泛。（很炫）
7.利用corrgram包中的corrgram()函數(shù)，可以以圖形化方式展示該相關系數(shù)矩陣嫌拣。（個人認為最炫）
