對于一些沒有生信基礎(chǔ)的同學(xué)來說荧嵌，想要從一堆未知功能的基因中挑選出想要的轉(zhuǎn)錄因子口糕，可能還要花費(fèi)大量的時(shí)間成本去學(xué)習(xí)這個(gè)過程托呕。而轉(zhuǎn)錄因子又在植物中起著非常重要的作用充甚，因此又不得不常常接觸到這一類操作，所以鞭执，我想了個(gè)辦法來給大家解決這個(gè)問題司顿。能夠解決的根本在于植物中的轉(zhuǎn)錄因子其實(shí)也就那些類芒粹，所以可以根據(jù)每一類的特點(diǎn)進(jìn)行總結(jié)。
從這個(gè)模塊開始大溜，輸入的文件不再是先前的比對文件而是蛋白質(zhì)文件化漆。輸入文件后，需要進(jìn)行一個(gè)格式化的過程钦奋，也就是①座云，點(diǎn)擊就好，也不需要知道它到底有什么作用锨苏，它的使命完成后GFAP會(huì)自動(dòng)刪除疙教。格式化完成后，選擇一個(gè)想要研究的家族伞租，在②的位置，它大致是這樣的：
前面是縮寫限佩，后面是具體名稱葵诈。選擇完成后，保存命名祟同，之后點(diǎn)擊③作喘，就可以完成整個(gè)過程。應(yīng)該不會(huì)超過1分鐘晕城。視頻展示
結(jié)果是這樣的：
會(huì)給你直接將結(jié)果展示在輸入框中泞坦。完成后下面又有一個(gè)保存命名，這里：
這個(gè)主要是為了提取序列的砖顷，設(shè)置好了以后贰锁，點(diǎn)擊④，它就可以將你需要的家族成員的序列從文件中給你提取出來滤蝠。
這個(gè)模塊還有另外一個(gè)分支豌熄，它的主要作用是對你輸入文件中所有的轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行一個(gè)統(tǒng)計(jì)，基本做法同上物咳，點(diǎn)擊按鈕的時(shí)候點(diǎn)擊identify這個(gè)锣险。結(jié)果是這樣子的：
當(dāng)然，如果你只想要統(tǒng)計(jì)全體览闰，選擇模塊的操作是非必須的芯肤。同時(shí)如果執(zhí)行的是統(tǒng)計(jì)全體，那么提取序列的功能也會(huì)失效压鉴，它針對的是單個(gè)家族崖咨。
接下來是針對整體的一個(gè)統(tǒng)計(jì)作圖。功能在這里
在上述操作完成后晴弃，你可以什么都不設(shè)置（因?yàn)榘ㄗ煮w掩幢，分辨率什么的逊拍，都已經(jīng)給大家設(shè)置好，是不是很貼心~）际邻，直接點(diǎn)擊按鈕即可芯丧。出來的是類似這種的：
包括有什么家族，以及家族成員的數(shù)量世曾。有圖了缨恒，就可以和審稿人吹一吹了，告訴他們在你所要研究的這個(gè)過程里到底哪些轉(zhuǎn)錄因子可能起著重要作用~轮听。雖然洋洋灑灑給同學(xué)們寫了這么多骗露，事實(shí)上，這個(gè)過程血巍，不會(huì)超過十分鐘萧锉，視頻為證。我在尋求一個(gè)高效的生信解決方案述寡，如果同學(xué)們覺得還湊合的話柿隙，就把它推薦給你的老師和同學(xué)們吧~
