課件來源：
7.3.3 真核生物的轉(zhuǎn)錄過程（3）_嗶哩嗶哩_bilibili
7.3.4 真核生物的轉(zhuǎn)錄過程（4）_嗶哩嗶哩_bilibili
大綱
RNA聚合酶Ⅱ的啟動子
RNA聚合酶Ⅱ的轉(zhuǎn)錄因子
RNA聚合酶Ⅱ
功能：負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄mRNA牺六，在cell中mRNA數(shù)量不多但種類巨大都许。因此，polyⅡ要識別的序列最為復(fù)雜虐秦。
Q：這些元件會同時出現(xiàn)嗎创坞？
A:
元件特點(diǎn)
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TATA box碗短，中文叫TATA框，非常保守且靠近啟動子端题涨，可視為真核生物中的“負(fù)10序列”偎谁，容易發(fā)生局部的解螺旋，而且在其解開后纲堵，能夠幫助轉(zhuǎn)錄起始定位巡雨。
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上游啟動子元件席函，是一類與啟動子活性相關(guān)的元件總稱。
Q：什么是方向/位置依賴性茂附？
A:在 RNA 轉(zhuǎn)錄中，啟動元件（promoter elements） 是啟動 RNA 聚合酶結(jié)合和轉(zhuǎn)錄起始的關(guān)鍵 DNA 序列营曼。這些元件具有明確的方向性和位置依賴性，對轉(zhuǎn)錄過程至關(guān)重要溶推。以下是對其方向性和位置依賴性的解釋：
** 啟動元件的方向性**
方向性含義：啟動元件具有特定的方向性徊件，其序列只能在一個方向上被識別和利用。這是因?yàn)閱釉械年P(guān)鍵序列（如 -10 區(qū)和 -35 區(qū)）在空間結(jié)構(gòu)上是特定的蒜危，僅支持 RNA 聚合酶沿 5' → 3' 方向的轉(zhuǎn)錄虱痕。
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影響方向性的因素：
- 序列特異性：啟動元件的堿基排列決定了 RNA 聚合酶的結(jié)合方向。例如辐赞，大腸桿菌中的 -10 區(qū)（TATAAT）和 -35 區(qū)（TTGACA）的相對位置和方向?qū)τ?RNA 聚合酶的識別至關(guān)重要部翘。
- RNA 聚合酶結(jié)構(gòu)：RNA 聚合酶本身的活性中心只能沿模板鏈的 3' → 5' 方向移動，以合成 5' → 3' 的 RNA响委。
實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象：如果反向插入啟動元件或改變其方向新思，RNA 聚合酶無法正確結(jié)合或只能產(chǎn)生反向轉(zhuǎn)錄的 RNA（通常無功能）窖梁。
啟動元件的位置依賴性
位置依賴性含義：啟動元件的核心序列通常位于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)（+1）上游的特定位點(diǎn)，其相對位置對 RNA 聚合酶的精確結(jié)合和轉(zhuǎn)錄起始至關(guān)重要夹囚。
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關(guān)鍵位點(diǎn)：
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原核生物：
- 核心啟動元件通常位于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游的 -10 區(qū)（Pribnow box） 和 -35 區(qū)纵刘。
- -10 和 -35 區(qū)之間的間隔通常為 16-18 bp，過長或過短會顯著降低轉(zhuǎn)錄效率荸哟。
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真核生物：
- TATA box 通常位于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)（+1）上游約 25-30 bp 處假哎，幫助 TATA 結(jié)合蛋白（TBP）和轉(zhuǎn)錄因子形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物。
- 一些增強(qiáng)子或抑制子元件可以位于啟動子區(qū)域較遠(yuǎn)的位置鞍历，但仍通過 DNA 的三維結(jié)構(gòu)調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄舵抹。
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原核生物：
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位置改變的影響：
- 如果啟動元件距離轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)過遠(yuǎn)，RNA 聚合酶可能無法正確識別劣砍。
- 對于原核生物惧蛹，改變 -10 和 -35 區(qū)之間的間隔長度會干擾 RNA 聚合酶與 DNA 的結(jié)合，影響轉(zhuǎn)錄起始刑枝。
總結(jié)
- 方向性：啟動元件的方向性由其特定的序列和 RNA 聚合酶的識別機(jī)制決定香嗓，反轉(zhuǎn)啟動元件會導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄失敗或異常。
- 位置依賴性：啟動元件必須位于特定位置以便 RNA 聚合酶正確識別和結(jié)合仅讽，位置的細(xì)微變化可能顯著影響轉(zhuǎn)錄效率陶缺。
這種方向和位置的依賴性確保了轉(zhuǎn)錄的精確性钾挟，使 RNA 聚合酶能夠準(zhǔn)確地合成 RNA洁灵，維持基因表達(dá)的正常進(jìn)行。
RNA聚合酶Ⅱ的轉(zhuǎn)錄因子
何解掺出？
基礎(chǔ)TFs=基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)所必需的TF徽千，沒有就無法完成轉(zhuǎn)錄。
特異性TFs=基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)中能使其高效（或降低）表達(dá)的TF汤锨。
總結(jié)：
