1.序列準(zhǔn)備
先準(zhǔn)備好需要比對的序列找颓，可以是DNA序列叮雳，也可以是Protein序列；
2.導(dǎo)入序列文件
進(jìn)入MEGA7軟件首頁说莫，點(diǎn)擊Align------Edit/Bulid Alignment-------Creat a new alignment-------OK储狭，之后會彈出來一個對話框：
我這里的是rRNA 的16S序列，因此選DNA刮萌；如果你的得是氨基酸序列着茸，那選不就選Protein嘛涮阔。然后軟件會彈出來一個新窗口用來輸入你準(zhǔn)備好的序列文件敬特，步驟是：點(diǎn)擊Data------Open-------Retrieve Sequences from File伟阔，之后軟件會彈出本地文件選擇框减俏，在界面上找到你的序列文件娃承，點(diǎn)擊"打開"历筝，你的序列就會顯示在屏幕上了梳猪，打這里春弥，你已經(jīng)完成了序列的導(dǎo)入了匿沛，是不是很簡單呢逃呼？你以為完了嗎抡笼，等等推姻，我們還沒有呢做比對呢藏古，咱們繼續(xù)哈。弟跑。。
3.序列對齊
咱們現(xiàn)在屏幕上的序列還是散亂排列的蔫敲，建樹之間需要把他們對齊了奈嘿，操作也很簡單裙犹，點(diǎn)擊Alignment---------Align by Muscle叶圃，同樣會彈出一個對話框掺冠，問你是否要用所以的序列進(jìn)行比對码党？（下圖2），我這里是要用所有的锌奴，直接點(diǎn)擊OK啦，但如果你的序列多了耻姥，也可以回到序列界面選擇其中的序列琐簇，再來點(diǎn)擊比對。 之后會彈出比對參數(shù)的對話框（下圖3）丈秩，具體每個條目是什么意思大家自行了解哈，我這里用的是默認(rèn)值肠牲。
比對結(jié)果就如下圖所示啦：
4.結(jié)果導(dǎo)出
點(diǎn)擊Data------Export Alignment有3種格式可供選擇，選擇你要的格式就好啦深碱。
這樣就完成了序列的比對了，我也是初來乍的新手呀竞膳，歡迎大家交流心得~~~3QU!!!...........
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