微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)畦攘、錯(cuò)配修復(fù)(MMR)和腫瘤突變負(fù)荷(TMB

1. 胚系突變

胚系突變(Germline Mutation)是指在人的胚胎發(fā)育期已經(jīng)攜帶的變異(幾乎全部遺傳自父母),存在于生殖細(xì)胞內(nèi)具有遺傳性十电,構(gòu)成人與人的遺傳多樣性知押。 人體的所有細(xì)胞均應(yīng)帶有一致的胚系突變;但并非所有胚系突變具有致病性

特點(diǎn): 先天性鹃骂,遺傳

2. 體細(xì)胞突變

體細(xì)胞突變(Somatic Mutation)是指人體某些組織或者器官后天性地發(fā)生了體細(xì)胞變異台盯,雖然它不會(huì)遺傳給后代個(gè)體,卻可以通過(guò)細(xì)胞分裂偎漫,遺傳給子代細(xì)胞爷恳。 體細(xì)胞突變對(duì)腫瘤的發(fā)生發(fā)展有關(guān)鍵性的作用 ,并且它也是制定腫瘤癌癥靶向治療措施的關(guān)鍵所在象踊。

特點(diǎn):后天性温亲,不遺傳

3. 腫瘤突變負(fù)荷

腫瘤突變負(fù)荷(tumor mutation burden,TMB ): 癌癥樣本全基因組中除去胚系DNA變異后每百萬(wàn)堿基體細(xì)胞突變數(shù)目杯矩。用來(lái)反映腫瘤細(xì)胞中總的基因突變程度的一個(gè)指標(biāo)栈虚。TMB水平高的腫瘤,代表其腫瘤細(xì)胞中基因突變水平高史隆,也反映細(xì)胞中可以被免疫系統(tǒng)識(shí)別的腫瘤新抗原可能更多魂务。 可以依據(jù)次預(yù)測(cè)IO 免疫治療的效果。

TMB 與PD-L1關(guān)系:TMB高的泌射,PD-L1不一定低粘姜。可以考慮同時(shí)檢測(cè)兩者

4. 微衛(wèi)星

微衛(wèi)星(microsatellite熔酷,MS)又稱為短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeats孤紧,STR),是基因組中以少數(shù)幾個(gè)核苷酸(2-4個(gè))為單位多次串聯(lián)重復(fù)組成的較長(zhǎng)(幾十個(gè))的核苷酸序列拒秘。最常見(jiàn)的有:雙核苷酸重復(fù)号显,{(AC)/(TG)}n等臭猜。

分布:廣泛分布于真核生物基因組中。

特點(diǎn):PCR擴(kuò)增押蚤,突變率高蔑歌,共顯性遺傳,多態(tài)性揽碘。

根據(jù)重復(fù)結(jié)構(gòu)不同分類(lèi)

完全重復(fù)型(perfect):?jiǎn)我恍蛄袉卧獰o(wú)中斷或顛倒次屠。

不完全重復(fù)型(imperfect):?jiǎn)我恍蛄袉卧兄袛嗷蛘哳嵉埂?/h3>

混合型(compound):介于兩者之間。微衛(wèi)星DNA重復(fù)序列兩側(cè)都有物種特異性的保守序列钾菊。

5. 微衛(wèi)星不穩(wěn)定性

微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(Microsatellite Instability帅矗,MSI )是指 DNA復(fù)制過(guò)程中,錯(cuò)配修復(fù)機(jī)制(DNA mismatch repair 煞烫,MMR)失靈,導(dǎo)致重復(fù)片段增加或者減少以致無(wú)法被機(jī)體修復(fù)累颂,引起微衛(wèi)星體長(zhǎng)度變化的現(xiàn)象滞详。

正常機(jī)體可以識(shí)別檢測(cè)錯(cuò)配合成的DNA,而腫瘤組織因突變等因素引起DNA修復(fù)蛋白出錯(cuò)紊馏,無(wú)法修復(fù)料饥。

根據(jù)MSI出現(xiàn)頻次分類(lèi)

1. 微衛(wèi)星穩(wěn)定性(microsatellite stability,MSS ):微衛(wèi)星不發(fā)生突變朱监。

2. 低頻微衛(wèi)星不穩(wěn)定性( low-frequency MSI岸啡,MSI-L):患者微衛(wèi)星突變發(fā)現(xiàn)率低。<40%

3. 高頻微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(High-frequency MSI赫编,MSI-H):與上述相反巡蘸。>40%

臨床價(jià)值:腫瘤預(yù)后預(yù)測(cè),免疫治療效果預(yù)測(cè)

6. 錯(cuò)配修復(fù)

錯(cuò)配修復(fù)(mismatch repair擂送,MMR )悦荒,是在含有錯(cuò)配堿基的DNA分子中,使核苷酸序列恢復(fù)正常的修復(fù)方式嘹吨。當(dāng)MMR基因發(fā)生胚系突變或者發(fā)生甲基化將引起MMR功能降低搬味,導(dǎo)致DNA序列堿基錯(cuò)配、缺失或插入不能得到修復(fù)蟀拷。

MMR過(guò)程涉及到的MMR protein:MutS(MSH2碰纬、3、6等)以及MutL(MLH1问芬、3悦析、PMS1、2)愈诚,MMR主導(dǎo)蛋白:MLH1她按、2牛隅、6、PMS2酌泰。其中MLH1蛋白編碼基因啟動(dòng)子區(qū)域收到甲基化調(diào)控媒佣,發(fā)生甲基化時(shí)會(huì)引起蛋白缺失。

根據(jù)MMR主導(dǎo)蛋白表達(dá)情況劃分為:錯(cuò)配修復(fù)基因缺陷(dMMR):4種蛋白有一種或以上表達(dá)缺失陵刹;錯(cuò)配修復(fù)基因完整(pMMR):四種蛋白均表達(dá)

7. MMR與MSI-H的關(guān)系

1. dMMR默伍,MSS。發(fā)生dMMR時(shí)衰琐,MSI可以為穩(wěn)定態(tài)也糊,原因:有的突變無(wú)傷大雅,不影響主要功能蛋白羡宙。

2. dMMR狸剃,MSI-H。但是當(dāng)主要蛋白編碼基因發(fā)生變異時(shí)狗热,錯(cuò)配修復(fù)功能受損钞馁,導(dǎo)致錯(cuò)誤的MSI修復(fù)失敗,發(fā)生MSI-H匿刮。

8. MMR與TMB的關(guān)系

當(dāng)腫瘤細(xì)胞中存在MMR基因功能缺失時(shí)(dMMR)僧凰,標(biāo)志著腫瘤細(xì)胞失去對(duì)DNA復(fù)制錯(cuò)誤的修復(fù)能力,這時(shí)腫瘤細(xì)胞內(nèi)將積累大量突變-->突變?cè)絹?lái)越多熟丸,腫瘤突變負(fù)荷(TMB)增加训措,進(jìn)而產(chǎn)生了相關(guān)新抗原-->淋巴細(xì)胞受到調(diào)動(dòng),抑制腫瘤生長(zhǎng)光羞,形成腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞绩鸣,免疫治療效果就越好。

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