生物信息文獻胃癌一篇(浙醫(yī)二院)
疑問:究竟是基因驅動的進展继蜡,還是伴隨進展的基因表達變化溺健?誰是始作俑者?
盡管醫(yī)療技術日益成熟惰蜜,但晚期胃癌患者的預后仍不能客觀確定昂拂。因此,迫切需要確定新的診斷和預后生物標志物抛猖。研究只在鑒定與胃癌分期機制和胃癌預后相關的潛在關鍵基因格侯?
方法:
- 進行動態(tài)趨勢分析,尋找在胃癌分期中具有相似趨勢的基因财著,以探索胃癌中差異表達的基因联四,并找出動態(tài)趨勢分析結果的交集。
- 對獲得的基因進行功能預測分析撑教,觀察預后基因在胃癌和胃癌分期中的表達情況以及與腫瘤免疫細胞浸潤的相關性朝墩。
- 根據(jù)癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫分析的結果,收集胃癌樣本并進行測序以進行后續(xù)分析伟姐。
結果顯示收苏,表達式富含模塊 0 的基因在胃癌分期中具有相似的趨勢。 篩選出3213個差異基因愤兵。 在具有相似趨勢的基因中總共獲得了50個交叉基因鹿霸,其中只有10個基因在胃癌中具有預后意義。 這10個基因在不同程度上與巨噬細胞浸潤相關秆乳。
- 在樣本測序結果中發(fā)現(xiàn)AGT明顯異常表達懦鼠。 AGT與胃癌的發(fā)生有關,并與brd9屹堰、golph3肛冶、nom1、klhl25和psmd11相互作用双藕。
結論:AGT在胃癌中異常表達淑趾,可能參與促進胃癌的進展阳仔。 該研究為進一步探索潛在的生物標志物和分子靶向胃癌治療提供了新的方向忧陪。
關鍵詞:RNA-seq; TNM階段近范; 生物信息學分析嘶摊; 胃癌; 腫瘤免疫細胞浸潤
Gao W, Yang M. Identification by Bioinformatics Analysis of Potential Key Genes Related to the Progression and Prognosis of Gastric Cancer. Front Oncol. 2022 May 4;12:881015. doi: 10.3389/fonc.2022.881015. PMID: 35600357; PMCID: PMC9114743.