SEER數(shù)據(jù)挖掘4.8分SCI發(fā)文思路

生信做膩了嗎宗弯?或者不做生信數(shù)據(jù)挖掘的痒玩,可以嘗試一下別的發(fā)文思路淳附,例如挖掘SEER數(shù)據(jù)庫的臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行發(fā)表SCI。本次分享的范文發(fā)表在FRONT ONCOL上蠢古,影響因子:4.848奴曙,中科院分區(qū):2區(qū)

文章題目:Breast Subtypes and Prognosis of Breast Cancer Patients With Initial Bone Metastasis: A Population-Based Study

研究背景:

轉(zhuǎn)移性乳腺癌是一種高度異質(zhì)性疾病草讶,骨骼是最常見的轉(zhuǎn)移部位之一洽糟。這項(xiàng)回顧性研究旨在調(diào)查患有初始骨轉(zhuǎn)移的乳腺癌患者的臨床特征,預(yù)后因素和手術(shù)獲益堕战。

研究方法:

從2010年到2015年坤溃,從SEER數(shù)據(jù)庫中分析了6,860名被診斷患有初始骨轉(zhuǎn)移的乳腺癌患者。采用單因素Cox和多因素Cox分析來確定預(yù)后因素践啄。根據(jù)從Cox回歸結(jié)果中選擇的因素進(jìn)行列線圖浇雹。根據(jù)不同的亞型,轉(zhuǎn)移負(fù)擔(dān)和通過列線圖區(qū)分的風(fēng)險(xiǎn)組繪制生存曲線屿讽。

研究結(jié)果:

與其他亞型相比昭灵,激素受體(HR)陽性/人表皮生長因子受體2(HER2)陽性患者表現(xiàn)出最好的預(yù)后。年齡較蟹ヌ浮(<60歲)烂完,白人,低年級诵棵,T期較低(<= T2)且未合并內(nèi)臟轉(zhuǎn)移的患者傾向于有更好的預(yù)后抠蚣。約37%(2,249)的患者接受了原發(fā)腫瘤手術(shù)。所有亞型的患者均可從手術(shù)中受益履澳。如果進(jìn)行手術(shù)嘶窄,僅骨轉(zhuǎn)移(BOM),骨和肝轉(zhuǎn)移距贷,骨和肺轉(zhuǎn)移的患者也顯示出更長的生存時(shí)間柄冲。但是,骨和腦轉(zhuǎn)移患者不能從手術(shù)中受益(p = 0.05)忠蝗。列線圖的C指數(shù)為0.66现横。列線圖點(diǎn)的臨界值被確定為87點(diǎn)和157點(diǎn),將所有患者分為低,中戒祠,高風(fēng)險(xiǎn)組骇两。所有組的患者在接受手術(shù)時(shí)均表現(xiàn)出更好的總體生存率。

研究結(jié)論:

我們的研究為初始骨轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者提供了基于人群的預(yù)后分析姜盈,并構(gòu)建了具有良好準(zhǔn)確性的預(yù)測列線圖低千。手術(shù)對整體生存的潛在益處的發(fā)現(xiàn)將為該組患者的治療策略提供一些啟示。

分析思路:

1贩据、從SEER數(shù)據(jù)庫下載相關(guān)數(shù)據(jù)栋操,然后整理好,進(jìn)行卡方檢驗(yàn)

2饱亮、進(jìn)行單因素和多因素Cox回歸分析

3矾芙、根據(jù)上面的結(jié)果,篩選出重要的臨床因素構(gòu)建模型并繪制列線圖

4近上、計(jì)算C-index和繪制校準(zhǔn)圖評價(jià)模型

5剔宪、根據(jù)風(fēng)險(xiǎn)評分和各臨床因素分組,分別繪制生存曲線壹无,看預(yù)后價(jià)值

像這種發(fā)文思路葱绒,分析操作往往都是比較簡單的。比較難的地方就是需要對臨床專業(yè)意義比較熟悉斗锭,同時(shí)還要看結(jié)果的陽性程度地淀,陽性程度越高,文章相對比較好發(fā)岖是。如果想文章能發(fā)在更好的專業(yè)期刊上帮毁,就很可能需要收集額外的數(shù)據(jù)進(jìn)行外部驗(yàn)證

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