這里是佳奧蓄髓！終于到了單細胞篇章，這將會是一個很長的系列舒帮，先前我們學習了R会喝，shell腳本以及轉錄組分析，有了這些基礎我們開始單細胞轉錄組的學習玩郊。
讓我們開始吧肢执！
重現(xiàn)的文章：Spatially and functionally distinct subclasses of breast cancer-associated fibroblasts revealed by single cell RNA sequencing
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30514914/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE111229
第一步：比對 STAR
第二步：評估 計算變異系數(shù)
第三步：數(shù)據(jù)分析 分群、差異分析RTOS edgeR DESeq2译红、細胞周期scran预茄、GO分析
第四步：結合公共數(shù)據(jù)庫
文章的表達矩陣：
QQ截圖20220830160203.png
要復現(xiàn)的圖：
QQ截圖20220830160337.png
QQ截圖20220830160353.png
那么下一篇，我們就正式開始單細胞轉錄組上游分析侦厚。
我們下一篇再見耻陕！
