Linux如何安裝軟件？
1.服務(wù)器下載conda-精華版--miniconda
2.安裝和配置miniconda
3.使用miniconda：查看已安裝的軟件、搜索、安裝桨嫁、卸載（生信需要的）軟件
4.定制conda的分身
！
份帐！
璃吧！
preparation
安裝bzip2(因?yàn)槊赓M(fèi)阿里云沒有)：輸入 yum install -y bzip2
install Miniconda（an App store）
download [64-bit (bash installer)] for my computer
官網(wǎng)下載
復(fù)制下載鏈接
登陸服務(wù)器，進(jìn)入wangyanhui1998目錄 (可使用tab鍵自動(dòng)補(bǔ)全目錄名)
右鍵黏貼(選中废境，鼠標(biāo)左鍵點(diǎn)一下是復(fù)制畜挨，右鍵點(diǎn)一下是粘貼)install
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
一路Enter筒繁，看到"please answer yes or no"輸入yes
">>>"按回車
[no] >>> 輸入yes
Thank you for installing miniconda3
- activate
source ~/.bashrc來(lái)激活conda
命令行輸入conda，出現(xiàn)滿屏的信息說(shuō)明成功了
不成功就將miniconda這個(gè)目錄刪除巴元，重新安裝
不要?jiǎng)h除安裝包否則得浪費(fèi)時(shí)間在下載上
參考演示視頻 無(wú)聲版
來(lái)自公眾號(hào)：生信星球
密碼：iwcd4k
- 添加鏡像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
USE
- 查看當(dāng)前所有軟件列表 conda list
- 搜索軟件 conda search fastqc 【這里以數(shù)據(jù)質(zhì)控軟件fastqc為例】
- 安裝軟件 conda install fastqc -y 【加上-y是自動(dòng)安裝】
- 卸載軟件 conda remove fastqc -y
總結(jié)
