一款咖、MMR是什么何暮?
DNA在復(fù)制過程中受外源或內(nèi)在因素的影響會發(fā)生各種各樣的錯誤,比如單/雙鏈斷裂铐殃、堿基錯配海洼、交聯(lián)損傷等等。幸運的是針對DNA損傷人體具有自我修復(fù)調(diào)節(jié)的系統(tǒng)富腊,才得以保持機體正常運轉(zhuǎn)坏逢。其中錯配修復(fù)系統(tǒng)(MMR,mismatch repair)可修復(fù)DNA復(fù)制時產(chǎn)生的堿基錯配錯誤赘被,進而維持基因組的穩(wěn)定性是整。
錯配修復(fù)系統(tǒng)家族成員包括MLH1,MSH2民假,MSH6和PMS2等蛋白浮入,錯配修復(fù)蛋白家族由兩個錯配修復(fù)功能的復(fù)合體構(gòu)成,其中MLH1和MLH2是兩個復(fù)合體內(nèi)的主要功能蛋白羊异。
錯配修復(fù)系統(tǒng)缺陷(dMMR, deficient mismatch repair)是由于這些蛋白功能出現(xiàn)了異常事秀。通惩希可以用免疫組化(IHC)的方法檢測以上4個MMR 蛋白表達情況,任一MMR蛋白缺失即為dMMR易迹。4個蛋白表達均正常則為pMMR宰衙。
二、MSI又是什么睹欲?
微衛(wèi)星(microsatellite, MS)是一些短而重復(fù)的DNA序列供炼,常見類型為雙堿基CA/GA/GT或單堿基A/T串聯(lián)重復(fù)等,且多以1-6bp為一個重復(fù)單元窘疮。
剛才我們也提到DNA在復(fù)制過程中本身就會出現(xiàn)一些錯誤袋哼,考慮到微衛(wèi)星這種串聯(lián)重復(fù)序列更容易使得DNA自我復(fù)制時發(fā)生“疲勞”,出現(xiàn)錯誤的概率就更大了考余。
如果此時錯配修復(fù)系統(tǒng)功能也出現(xiàn)異常胸嘴,那么微衛(wèi)星出現(xiàn)的復(fù)制錯誤得不到及時糾正并不斷累積蔽午,使得微衛(wèi)星序列長度或堿基組成發(fā)生改變,這種結(jié)果現(xiàn)象稱之為微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(microsatellite instability,? MSI)塔粒。
三含懊、MSI怎么檢測評估身冬?
01.多重?zé)晒釶CR毛細管電泳法
該方法是目前公認的MSI檢測“金標準”, 通常檢測正常組織和腫瘤組織中MSI位點岔乔,然后通過比較確定腫瘤樣本中微衛(wèi)星不穩(wěn)定位點數(shù)量來判斷腫瘤樣本的MSI狀態(tài)酥筝。
國內(nèi)專家共識推薦采用5 ~ 7個微衛(wèi)星位點組合(BAT-25、BAT-26雏门、NR-21嘿歌、NR-22、NR-24茁影、NR-27宙帝、MONO-27)進行MSI的檢測。MSI結(jié)果的判讀一般遵循:2個或2個以上標記顯示不穩(wěn)定為MSI-H募闲;有1個標記顯示不穩(wěn)定為MSI-L步脓;所有位點都穩(wěn)定為MSS。
02.高通量測序法(NGS)
隨著高通量測序技術(shù)的突破發(fā)展以及日漸豐富的臨床使用場景浩螺,NGS檢測MSI狀態(tài)也有它獨特的優(yōu)勢靴患,一次性可以檢測評估更多微衛(wèi)星序列,于此同時還可以附帶其他有價值的檢測結(jié)果信息要出。
四鸳君、MSI狀態(tài)評估各方法學(xué)比較
五、dMMR不等于MSI-H
MSI與MMR關(guān)系密切, 一定程度上患蹂,dMMR ≈ MSI-H或颊;pMMR ≈ MSS + MSI-L砸紊。但是由于MMR和MSI檢測在檢測主體和檢測技術(shù)平臺上均不相同,這又讓其存在不完全相符合的問題饭宾。
六批糟、MMR蛋白檢測與MSI狀態(tài)不一致的情況及對應(yīng)原因
01.dMMR,但MSS
MMR蛋白缺失(MSH6蛋白)看铆,但是其功能被(MSH3蛋白)代償徽鼎,依然可以修復(fù)錯配基因,但是我們IHC檢測時并不包含MSH3蛋白弹惦,使得結(jié)果保持MSS否淤;
02.pMMR,但MSI-H
MMR基因發(fā)生錯義突變棠隐,MMR蛋白功能會出現(xiàn)異常但其抗原結(jié)構(gòu)可能不會受到影響石抡。這種情況下,IHC檢測到MMR蛋白是正常表達的助泽,即pMMR啰扛,但其實錯配修復(fù)功能是異常的,這也就導(dǎo)致了MSI的檢測結(jié)果顯示為MSI-H嗡贺;
由MMR基因以外的其它基因突變引起的MSI-H(比如POLE/D)隐解。
七、MMR蛋白檢測與MSI狀態(tài)不一致怎么處理诫睬?
《結(jié)直腸癌及其他相關(guān)實體瘤微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測中國專家共識》指出煞茫,如果遇到患者同時進行IHC-MMR蛋白表達和DNA分析(PCR或NGS法)MSI狀態(tài)檢測且檢測結(jié)果不一致的情況,可考慮采用第3種方法(NGS或PCR法)進行驗證(部分專家推薦)摄凡。
飛朔生物MSI產(chǎn)品一次性檢測34個MSI位點续徽,容錯率較高,為常見實體瘤免疫用藥療效評估保駕護航亲澡。
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