有人會(huì)說純生信SCI是“垃圾論文”孽尽，一直忽略它的研究意義浩嫌，大多數(shù)做純生信數(shù)據(jù)挖掘的人都是沒有錢做驗(yàn)證的超歌，故沒有辦法證明某一分子是否促進(jìn)/抑制腫瘤發(fā)生發(fā)展葬馋，更沒有辦法探索其具體作用機(jī)制卖鲤，沒有辦法展現(xiàn)它的真實(shí)研究意義。不過話也說回來畴嘶，不是所有純生信篩選出來的分子都能夠被實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證蛋逾，做實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證也是存在一定風(fēng)險(xiǎn)的，可能花費(fèi)了很多經(jīng)費(fèi)窗悯，到最后什么結(jié)果都沒有得到区匣。
今天分享一篇14分+SCI文章，這篇文章也是從TCGA數(shù)據(jù)挖掘開始做起的蒋院，然后通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證以及作用機(jī)制的探索等一系列分析將文章發(fā)到Nature Communications上的亏钩。文章題目：METTL3 promotes tumour development by decreasing APC expression mediated by APC mRNA
N6-methyladenosine-dependent YTHDF binding（PMID: 34155197），如果感興趣的話欺旧，可以自己下載進(jìn)行詳細(xì)閱讀姑丑。
究竟是如何操作的呢？
1辞友、通過數(shù)據(jù)挖掘篩選目標(biāo)分子
一般都是通過下載TCGA數(shù)據(jù)栅哀，做差異分析震肮，確定表達(dá)是否上調(diào)或者下調(diào)，然后進(jìn)行預(yù)后分析留拾，是否有值得研究戳晌，然后到GEO數(shù)據(jù)庫找一下相關(guān)數(shù)據(jù)，如果能找到的話痴柔，就利用GEO數(shù)據(jù)進(jìn)行驗(yàn)證先（做完這些的話就可以發(fā)一篇純生信的SCI躬厌，很多1-3分的文章就是這樣來的）。上面的差異分析都是基于數(shù)據(jù)挖掘的竞帽，其實(shí)不一定可信扛施，然后需要用自己臨床樣本進(jìn)行進(jìn)行一步的驗(yàn)證，結(jié)果才會(huì)比較可靠屹篓。（有少量經(jīng)費(fèi)的人疙渣，可以做純生信+簡(jiǎn)單實(shí)驗(yàn)）
2、體內(nèi)外證明目標(biāo)分子具有促進(jìn)/抑制腫瘤發(fā)生發(fā)展的作用（純生信+一般實(shí)驗(yàn)堆巧，需要一定的經(jīng)費(fèi)妄荔，風(fēng)險(xiǎn)一般）
3、作用機(jī)制的探索（最難的一步谍肤，沒有國(guó)自然基金的話啦租，就不用看了，同時(shí)也是風(fēng)險(xiǎn)最大的 分析操作荒揣，需要一定的前期工作篷角，而且陽性結(jié)果不容易出來）。
