1. 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)推斷的難題 在RNA-seq中進(jìn)行兩組間的差異分析是最正常不過(guò)的了索赏。 我們?cè)谄渌鼘?shí)驗(yàn)中同樣會(huì)遇到類似的分析盼玄，通常，我們可以用方差分析判定兩組“分布”數(shù)據(jù)間...
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RNA-seq中的那些統(tǒng)計(jì)學(xué)問(wèn)題（一）為什么是負(fù)二項(xiàng)分布？ -
北京基因組所研究生<br><br>Focus on Bioinformatics and Machine-Learning<br><br>Follow me on Github: <a href="https://github.com/Ming-Lian" rel="nofollow" target="_blank">https://github.com/Ming-Lian</a><br><br>跳出局部最優(yōu)，搜索全局最優(yōu)
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R包goseq的GO富集分析（有參情形）
前面已經(jīng)講述了R包c(diǎn)lusterProfiler的GO富集分析[http://www.reibang.com/p/51af63922e26]方法融涣，本篇繼續(xù)演示R包goseq...
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使用clusterProfiler進(jìn)行GO威鹿、KEGG富集分析（有參情況）尋找差異表達(dá)的基因并識(shí)別它們的功能剃斧，是我們進(jìn)行RNA測(cè)序的最主要目的。很明顯忽你，這些差異的基因必然與功能改變密切相關(guān)幼东，例如，比較患病個(gè)體與正常個(gè)體的組織表達(dá)譜，不難想到這些顯著...
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GEO，TCGA數(shù)據(jù)挖掘（連載中）
一娜亿，對(duì)GEO的簡(jiǎn)單介紹丽已，下載數(shù)據(jù) 個(gè)人認(rèn)為，對(duì)GEO那些復(fù)雜的介紹买决，我是根本記不住沛婴。所以我挑選了一些必須用到，容易記住和理解的知識(shí)給大家督赤。 一：首先是對(duì)GSE嘁灯，GSM , 和...
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GO丑婿，KEGG，GSEA富集分析筆記
what is Gene Ontology ?——基因本體論 1 没卸， 什么是本體論羹奉？簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō)，就是我們對(duì)一個(gè)具體事物進(jìn)行分類并予以描述约计。例如：貓是一種哺乳動(dòng)物/貓是貓科動(dòng)物/...
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2021-07-01 GO煤蚌、kegg富集分析What：什么是GO和KEGG耕挨？ GO全稱是Gene Ontology，它分為：細(xì)胞組分（cellular component, CC）尉桩、分子功能（molecular fun...
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轉(zhuǎn)移陣地公告
我的所有文章都轉(zhuǎn)移到語(yǔ)雀筒占，并持續(xù)更新≈├纾或者也可以在國(guó)民聊天軟件上搜索生信星球公眾號(hào)赋铝，或者簡(jiǎn)信私聊找我要聯(lián)系方式。 我2018年下半年開始做知識(shí)分享沽瘦，到現(xiàn)在已經(jīng)快三年了革骨，都是在...
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從0開始，包括軟件安裝棚潦，環(huán)境設(shè)置令漂，原始數(shù)據(jù)下載，轉(zhuǎn)換丸边，差異基因分析等整個(gè)流程
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