免疫細(xì)胞類型:B cellsB cells memoryB cells naive T cellsT cells naive Dendritic cells 樹突細(xì)胞Macr...
免疫細(xì)胞類型:B cellsB cells memoryB cells naive T cellsT cells naive Dendritic cells 樹突細(xì)胞Macr...
基因家族生物信息學(xué)分析 (1)基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通過基因復(fù)制進(jìn)行物種特異性擴(kuò)增绘证,主要有染色體片段復(fù)制赚爵、串聯(lián)復(fù)制和反轉(zhuǎn)錄子轉(zhuǎn)座等三種形式,可能導(dǎo)致功能丟...
上一節(jié)我們介紹了植物是由種子萌發(fā)而來,胚芽發(fā)育成地面上的莖葉梨州,胚根發(fā)育成地面下的根蛛碌,植物需要進(jìn)一步生長和發(fā)育就離不開這些營養(yǎng)器官究反,這一節(jié)我就來用較長的篇幅系統(tǒng)地闡述一下植物的...
放一張效果圖琅锻,這些卦停,三四年前的東西,我其實(shí)一直懶得說恼蓬。 寫在前面 “Gene Structure View (Advanced)”這個(gè)功能可以說惊完,也是一時(shí)興起寫出來的。開發(fā)的...
目錄MCScanX下載及安裝數(shù)據(jù)準(zhǔn)備MCScanX運(yùn)行及結(jié)果Ka & Ks 計(jì)算下游畫圖腳本最后 MCScanX有兩個(gè)主要的功能, 一是, 方便使用者發(fā)現(xiàn)共線性(collin...
1.首先安裝BiocManager包如果你的R版本為3.6版本处硬,請將版本號設(shè)置為version = "3.11"version = "3.12"適用于R 4.0.0 2.通過...
進(jìn)化樹或者系統(tǒng)發(fā)育樹在微生物及群體結(jié)構(gòu)分析中是很常見的分析條目小槐。進(jìn)化樹構(gòu)建有很多方法,結(jié)果也大體相似荷辕,但是最終呈現(xiàn)的形式確是多種多樣的凿跳,今天給大家介紹使用itol進(jìn)行進(jìn)化樹的...
Emmm, 今天的主圖, 寫在前面 博士畢業(yè)論文中疮方,使用的樣品包括: 不同的類型 / 或者說不同的組織 不同的時(shí)間 / 或者說時(shí)間序列所以控嗜,是一個(gè)多X多的設(shè)計(jì)。對于這類實(shí)驗(yàn)設(shè)...
GO富集介紹每個(gè)基因都會對應(yīng)有一個(gè)或多個(gè)GO term(也就是GO功能)骡显。富集涉及到兩個(gè)概念:前景基因和背景基因疆栏。前景基因就是你關(guān)注的要重點(diǎn)研究的基因集,背景基因就是所有的基...
寫在寫在前面的前面 或許壁顶,沒有人知道TBtools到底是什么?能干啥石挂。但是看完這個(gè)推文博助,或許你就知道了其中的一部分。 寫在前面 TBtools對外開放兩年多痹愚,不時(shí)會有熟悉的不...
寫在前面繪制某一基因家族的進(jìn)化樹富岳,這是基因組學(xué)研究過程中不可缺少的一部分。劃分成不同的基因家族的依據(jù)一般是其具有某一相同的結(jié)構(gòu)域拯腮,下面我將以水稻中GUB_WAK_bind類家...
寫在前面 我受夠了动壤!整天有人問萝喘,TBtools怎么畫這個(gè)圖 但是我其實(shí)只想回一句: 你畫這個(gè)圖干什么?有什么意義?你想說談什么生物學(xué)故事阁簸? 承認(rèn)吧爬早,你什么都不知道,什么都沒搞...
主要是參考https://www.tinymind.net.cn/articles/64d36abc7fd091 首先我們拿到的是以下的材料 1. Blast比對 根據(jù)以下選...
寫在前面 類似的主題筛严,我們已經(jīng)推出了一篇主題為《一鍵完成共線性(MCScanX)分析》的文章。推出之后一部分人用著挺好饶米。也有相當(dāng)部分朋友卻不知為何遇到各種各樣的問題桨啃。這些問題...
首先非常感謝CJ老師開發(fā)的TBtools工具,給生信分析帶來了極大的便利檬输,詳細(xì)內(nèi)容介紹請參考http://www.reibang.com/p/f39bff6c4746 一 ...
首先非常感謝Cj大神開發(fā)出來的TBtools生信工具照瘾,為生信分析做圖帶來了極大的便利。作為生信小白丧慈,在做多物種間共線性分析時(shí)析命,嘗試了多種方法,苦于沒有計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)逃默,一直沒能完成...
conda已經(jīng)安裝orthofinder2碳却,試運(yùn)行了一下,目前的問題: 1.跑出的結(jié)果不知道怎么用:哪些結(jié)果可以用作下一步分析笑旺?下一步分析要做什么昼浦?怎么做? 2.-M rax...