免疫細(xì)胞類型:B cellsB cells memoryB cells naive T cellsT cells naive Dendritic cells 樹突細(xì)胞Macr...
免疫細(xì)胞類型:B cellsB cells memoryB cells naive T cellsT cells naive Dendritic cells 樹突細(xì)胞Macr...
基因家族生物信息學(xué)分析 (1)基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通過基因復(fù)制進(jìn)行物種特異性擴(kuò)增,主要有染色體片段復(fù)制超升、串聯(lián)復(fù)制和反轉(zhuǎn)錄子轉(zhuǎn)座等三種形式干像,可能導(dǎo)致功能丟...
上一節(jié)我們介紹了植物是由種子萌發(fā)而來,胚芽發(fā)育成地面上的莖葉倦畅,胚根發(fā)育成地面下的根遮糖,植物需要進(jìn)一步生長(zhǎng)和發(fā)育就離不開這些營(yíng)養(yǎng)器官,這一節(jié)我就來用較長(zhǎng)的篇幅系統(tǒng)地闡述一下植物的...
放一張效果圖赛不,這些,三四年前的東西罢洲,我其實(shí)一直懶得說踢故。 寫在前面 “Gene Structure View (Advanced)”這個(gè)功能可以說,也是一時(shí)興起寫出來的奏路。開發(fā)的...
目錄MCScanX下載及安裝數(shù)據(jù)準(zhǔn)備MCScanX運(yùn)行及結(jié)果Ka & Ks 計(jì)算下游畫圖腳本最后 MCScanX有兩個(gè)主要的功能, 一是, 方便使用者發(fā)現(xiàn)共線性(collin...
1.首先安裝BiocManager包如果你的R版本為3.6版本畴椰,請(qǐng)將版本號(hào)設(shè)置為version = "3.11"version = "3.12"適用于R 4.0.0 2.通過...
進(jìn)化樹或者系統(tǒng)發(fā)育樹在微生物及群體結(jié)構(gòu)分析中是很常見的分析條目。進(jìn)化樹構(gòu)建有很多方法鸽粉,結(jié)果也大體相似斜脂,但是最終呈現(xiàn)的形式確是多種多樣的,今天給大家介紹使用itol進(jìn)行進(jìn)化樹的...
Emmm, 今天的主圖触机, 寫在前面 博士畢業(yè)論文中帚戳,使用的樣品包括: 不同的類型 / 或者說不同的組織 不同的時(shí)間 / 或者說時(shí)間序列所以,是一個(gè)多X多的設(shè)計(jì)儡首。對(duì)于這類實(shí)驗(yàn)設(shè)...
GO富集介紹每個(gè)基因都會(huì)對(duì)應(yīng)有一個(gè)或多個(gè)GO term(也就是GO功能)片任。富集涉及到兩個(gè)概念:前景基因和背景基因。前景基因就是你關(guān)注的要重點(diǎn)研究的基因集蔬胯,背景基因就是所有的基...
寫在寫在前面的前面 或許,沒有人知道TBtools到底是什么氛濒?能干啥产场。但是看完這個(gè)推文,或許你就知道了其中的一部分舞竿。 寫在前面 TBtools對(duì)外開放兩年多京景,不時(shí)會(huì)有熟悉的不...
寫在前面繪制某一基因家族的進(jìn)化樹,這是基因組學(xué)研究過程中不可缺少的一部分骗奖。劃分成不同的基因家族的依據(jù)一般是其具有某一相同的結(jié)構(gòu)域确徙,下面我將以水稻中GUB_WAK_bind類家...
寫在前面 我受夠了鄙皇!整天有人問芜赌,TBtools怎么畫這個(gè)圖 但是我其實(shí)只想回一句: 你畫這個(gè)圖干什么?有什么意義伴逸?你想說談什么生物學(xué)故事较鼓? 承認(rèn)吧,你什么都不知道违柏,什么都沒搞...
主要是參考https://www.tinymind.net.cn/articles/64d36abc7fd091 首先我們拿到的是以下的材料 1. Blast比對(duì) 根據(jù)以下選...
寫在前面 類似的主題,我們已經(jīng)推出了一篇主題為《一鍵完成共線性(MCScanX)分析》的文章漱竖。推出之后一部分人用著挺好禽篱。也有相當(dāng)部分朋友卻不知為何遇到各種各樣的問題。這些問題...
首先非常感謝CJ老師開發(fā)的TBtools工具馍惹,給生信分析帶來了極大的便利躺率,詳細(xì)內(nèi)容介紹請(qǐng)參考http://www.reibang.com/p/f39bff6c4746 一 ...
首先非常感謝Cj大神開發(fā)出來的TBtools生信工具,為生信分析做圖帶來了極大的便利万矾。作為生信小白悼吱,在做多物種間共線性分析時(shí),嘗試了多種方法良狈,苦于沒有計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)后添,一直沒能完成...
conda已經(jīng)安裝orthofinder2,試運(yùn)行了一下薪丁,目前的問題: 1.跑出的結(jié)果不知道怎么用:哪些結(jié)果可以用作下一步分析遇西?下一步分析要做什么?怎么做严嗜? 2.-M rax...