目前的情況估計北京的學校半年都開不了學系宫，簡直快把做實驗的生物狗逼成搗騰數(shù)據(jù)的程序猿了，再不開學都快忘了實驗怎么做了∥涯欤現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)了數(shù)學是限制我學生信的最終原因，不過生物學這邊更注...
IP屬地：上海
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遺傳學 博士研究生在讀
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空間轉錄組國產(chǎn)平臺之光------STOmicshello，大家好寒砖，又周四了赐劣，感覺自己什么都沒干，時間就過完了哩都，一想起時間如此的快速隆豹，特別傷心茅逮，比當初被踹還嚴重。 今天我們要繼續(xù)空間轉錄的內(nèi)容判哥，不過今天我們需要介紹一個國產(chǎn)...
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10X空間轉錄組和10X單細胞數(shù)據(jù)聯(lián)合分析方法匯總大家好，新的一年開始了塌计，我們又要投入到緊張的工作中去了，作為一名10X空間和10X單細胞分析的生信人員锌仅，也要開始新一年的工作了章钾，但是热芹，正可謂磨刀不誤砍柴功贱傀，總結也是一種進步，...
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Bismark Bisulfite Mapper學習筆記（二）甲基化信息提取以及文件解讀(IV)Bismark甲基化提取 Bismark附帶一個補充的bismark_methylation_extractor腳本捌刮，它對Bismark結果文件進行操作，并對每個C進...
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CITE-seq：同時測細胞表面蛋白和RNA的單細胞測序單細胞測序方法和原理系列： 1. 單細胞轉錄組建庫原理：SMART糊啡、TargetAmp和10X genomics[http://www.reibang.com/p/6c5d...
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如何優(yōu)雅的閱讀Seurat包20211109（周二）1.今天準備學習scanpy單細胞分析包吁津，走在路上想，我用seurat和scanpy的意義在哪里碍脏，多學一個軟件嗎梭依？學習軟件后面的代碼邏輯 遠遠大于學會...
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Motif分析百寶箱（一）
作者：snail審稿：童蒙編輯：amethyst What's Motif? 模體（Motif）是指序列中局部的保守區(qū)域典尾，或者是一組序列中共有的一小段序列模式役拴；與轉錄因子钾埂、組...
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廈大本科姜性，清華生科院博士生在讀，對表觀遺傳部念，計算生物學，發(fā)育生物學領域感興趣
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【r<-函數(shù)】do.call的使用
do.call這個函數(shù)是我在搜索問題時會看到別人經(jīng)常使用的一個函數(shù)氨菇，心生好奇，這次來看看它的用法查蓉。 從文檔來看乌询，do.call可以通過名字構建和執(zhí)行函數(shù)，并且將參數(shù)以列表的形...
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結構變異SV分析(WGS/WES)和融合基因檢測（RNA）
69種工具檢測SV對比 http://www.reibang.com/p/85ff211b4b4e[http://www.reibang.com/p/85ff211b4...
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69種軟件檢測WGS結構變異SV的算法評估前言 最近在研究低深度WGS數(shù)據(jù)檢測SV變異驻龟，測試了很多個軟件，一直沒有一個準確的結論缸匪。周一很巧地發(fā)現(xiàn)了這篇文章翁狐，作者收集了市面上幾乎所有的SV檢測工具，用真實數(shù)據(jù)和模擬數(shù)據(jù)...
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為啥一定要用殘差圖檢查你的回歸分析露懒？先說殘差圖究竟是什么鬼。 殘差圖是指以殘差為縱坐標砂心，以任何其他指定的量為橫坐標的散點圖懈词。(上圖僅是殘差的示意圖辩诞，非殘差圖坎弯，殘差圖可見下文) 用普通最小二乘法(OLS)做回歸分...
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左手代碼译暂，右手寫作：你必須會的Jupyter Notebook在數(shù)據(jù)分析的道路上抠忘，你一定曾有過為新發(fā)現(xiàn)而激動不已的時刻，此時你急于將自己的發(fā)現(xiàn)告訴大家外永，卻遇到了這樣的問題：如何將我的分析過程清晰地表述出來呢崎脉？ 為了能與同行們有效溝通，你...
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deepTools 使用指南deepTools 是一套基于python開發(fā)的工具，適用于有效處理分析高通量測序數(shù)據(jù)呛踊，可用于ChIP-seq, RNA-seq 或 MNase-seq。 #1. deepT...
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第1篇：ATAC-seq的背景介紹以及與ChIP-Seq的異同ATAC-Seq簡介 ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput seq...
