老師您好，請問GEO的芯片可以取log后做WGCNA和免疫浸潤嗎艰额？
芯片數(shù)據(jù)和RNA-seq的差異分析流程由于太久沒有分析過bulk數(shù)據(jù)了捕传，前幾天突然被要求分析一個文章的數(shù)據(jù)時有點亂了手腳赤拒，所以在這里想總結(jié)一下關(guān)于芯片數(shù)據(jù)與seq數(shù)據(jù)的差異分析流程。 假如你是小白，也剛剛了解NG...
IP屬地：四川
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芯片數(shù)據(jù)和RNA-seq的差異分析流程由于太久沒有分析過bulk數(shù)據(jù)了枝哄，前幾天突然被要求分析一個文章的數(shù)據(jù)時有點亂了手腳肄梨，所以在這里想總結(jié)一下關(guān)于芯片數(shù)據(jù)與seq數(shù)據(jù)的差異分析流程。 假如你是小白挠锥，也剛剛了解NG...
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你好众羡，請問這個問題解決了嗎，我也想知道
GEO/TCGA數(shù)據(jù)是否需要標準化的問題
一.對于芯片數(shù)據(jù)： GEO中的Series Matrix File(s)通常是經(jīng)過了標準化和對數(shù)轉(zhuǎn)換的數(shù)據(jù)蓖租，但是不是所有的都是 具體判斷方法： 表達量是否需要重新標準化： 可...
